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【发明公布】一种LRPPRC特异性核酸适配体及其应用_中国科学院化学研究所_201810348192.3 

申请/专利权人:中国科学院化学研究所

申请日:2018-04-18

公开(公告)日:2018-08-17

公开(公告)号:CN108410878A

主分类号:C12N15/115(2010.01)I

分类号:C12N15/115(2010.01)I;A61K31/7088(2006.01)I;A61K45/06(2006.01)I;A61P35/00(2006.01)I

优先权:

专利状态码:有效-授权

法律状态:2022.05.06#授权;2018.09.11#实质审查的生效;2018.08.17#公开

摘要:本发明涉及一种特异性识别LRPPRC的核酸适体R14,其序列如SEQ ID NO:1所示。所述核酸适体R14能够通过阻断LRPPRC的正常组织功能、干扰细胞周期进展,抑制肿瘤细胞增殖。本发明还提供特异性识别LRPPRC的核酸适体R14与SRC激酶抑制剂在联合治疗肿瘤中的用途。核酸适体R14增强肿瘤对SRC激酶抑制剂的敏感性,SRC激酶抑制剂消除由核酸适配体R14导致的SRC激酶活性异常激活。

主权项:1.一种LRPPRC特异性核酸适配体,其包含:aSEQ ID NO:1所示序列的核酸;或b在SEQ ID NO:1所示序列的基础上缺失、取代、添加、插入一个或几个核苷酸,且具有与LRPPRC特异性结合的功能。

全文数据:一种LRPPRC特异性核酸适配体及其应用技术领域[0001]本发明属于医药领域,涉及用于治疗肿瘤的核酸适体药物,具体涉及一种特异性识别LRPPRC的核酸适体药物及其治疗肿瘤的用途,更具体LRPPRC特异性核酸适配体与SRC激酶抑制剂在治疗肿瘤方面的应用。背景技术[0002]癌症已发展为人类健康的头号杀手,每年全球因癌症死亡人数大约为700万。随着细胞生物学的发展以及对癌症发病机制的了解,癌症的化学药物治疗得到了很好的发展。目前大约有90多种化学药物发展用于杀死肿瘤细胞和癌症治疗。但是这些药物缺乏特异性,在临床上通常给患者带来致命的副作用。因此需要发展特异性杀死肿瘤或抑制其生长的靶向药物。[0003]Src是一类癌基因,其表达产物主要是酪氨酸蛋白激酶类。Src酪氨酸激酶联系的受体对细胞的生长和分裂是非常重要的,它具有双重作用,既可以作为一种受体,又可以作为一种酶酪氨酸激酶)。在其休眠状态时,酶的活性部位是关闭着的,但当受体被信号分子激活,其活性部位被打开,同时在细胞内部产生级联信号,这种信号可以是基因激活,蛋白质被大量合成,细胞因此大量复制,繁殖分化。当其表达过度时,就有可能导致肿瘤等疾病的发生。酪氨酸激酶抑制剂可作为三磷酸腺苷ATP与酪氨酸激酶结合的竞争性抑制剂,也可作为酪氨酸的类似物,阻断酪氨酸激酶的活性,抑制细胞增殖,目前已经开发了数种用于抗肿瘤的酪氨酸激酶抑制剂。然而,由于细胞含有复杂的信号转导通路,即使抑制了肿瘤细胞的某些信号途径,另外一些途径仍可以转导信号,并可能产生代偿性而上调,因此Src激酶抑制剂治疗肿瘤的效果有待提高,并且也容易产生药物耐受性。[0004]LRPPRC富含亮氨酸的三角状五肽重复基序蛋白)是一种线粒体蛋白,它的突变与细胞色素c氧化酶缺陷(cytochromecoxidasedeficiency及Leigh综合征(LeighSyndrome的发生密切相关。既往文献报道LRPPRC在许多肿瘤组织中高表达并与患者预后密切相关,如:肝癌,胃癌,食管癌,结肠癌,淋巴瘤以及前列腺癌等,因此LRPPRC可作为诊断标记或预后评估的指标。然而,目前LRPPRC是否可以作为肿瘤治疗的靶点、肿瘤治疗效果及治疗机理等尚不清楚。[0005]核酸适体是通过指数富集的配体系统进化法从DNARNA文库中筛选出来的单链寡核酸分子ssDNA或ssRNA。它通过分子内碱基堆积、疏水、氢键和静电等作用力折叠成独特的空间结构,从而与靶标高亲和性高特异性的结合。作为肿瘤治疗试剂,核酸适配体具有很多优点如较低的分子量、无免疫原性、快速的组织通透性和良好的代谢动力学。同时核酸适体可通过自动化的固相合成的方法制备,合成工艺可控稳定,价格低廉并且容易进行后期化学修饰。更重要的是,与抗体相比,核酸适体的靶标范围更广。一些与疾病紧密相关的生长因子、酶、受体以及肿瘤标志物等物质都能成为核酸适体的靶标。目前针对血管表皮生长因子受体的核酸适体作为治疗老年湿性黄斑疾病药物已经被FDA批准上市;同时还有八种核酸适体药物处于不同临床考察阶段。因此针对与疾病相关分子的核酸适体作为一种潜在治疗药物吸引着研宄者的注意。发明内容[0006]为解决上述问题,本发明人基于活细胞的筛选技术,筛选到了一种特异性识别肿瘤相关祀点LRPPRCleucinerichpentatricopeptiderepeatcontaining核酸适配体R14。鉴于核酸适配体R14能够扰乱LRPPRC的正常分子功能,该核酸适配体是一个有前景的肿瘤治疗性效应分子。[0007]—方面,本发明提供一种LRPPRC特异性核酸适配体,其包含:[0008]aSEQIDNO:1所示序列的核酸;或[0009]⑹在SEQIDNO:1所示序列的基础上缺失、取代、添加、插入一个或几个核苷酸,且具有与LRPPRC特异性结合的功能。[0010]本发明所述LRPPRC特异性核酸适配体,其中所述核酸适配体还可以包含选自下组的一种或多种修饰:[0011]a所述核酸适体中的一个或多个碱基用天然或人工合成的修饰碱基替代;[0012]〇所述核酸适体的骨架被修饰为硫代磷酸酯骨架;[0013]c所述核酸适体被修饰为肽核酸;[0014]d所述核酸适体用聚乙二醇修饰;[0015]所述核酸适配体的修饰不改变其特异性结合LRPPRC的功能。[0016]第二方面,本发明提供一种药物组合物,其包含本发明所述LRPPRC特异性核酸适配体。[0017]本发明所述药物组合物,其特征在于所述药物组合物中还包含SRC激酶抑制剂。[0018]本发明所述药物组合物,其特征在于所述SRC激酶抑制剂包括达沙替尼、博舒替尼、或KX2-391等。[0019]第三方面,本发明还提供所述LRPPRC特异性核酸适配体在制备治疗肿瘤药物中的用途。[0020]其中,所述LRPPRC特异性核酸适配体单独用于制备治疗肿瘤药物、或与SRC激酶抑制剂联合用于制备治疗肿瘤药物。[0021]所述SRC激酶抑制剂包括达沙替尼、博舒替尼、KX2-391等。[0022]所述肿瘤为肺癌,特别是非小细胞肺癌和肺腺癌。[0023]第四方面,本发明还提供所述LRPTOC特异性核酸适配体在制备用于增强SRC激酶抑制剂的肿瘤抑制活性中的用途。[0024]其中,所述SRC激酶抑制剂包括达沙替尼、博舒替尼、KX2-391等。[0025]其中,所述的肿瘤为肺癌,特别是非小细胞肺癌和肺腺癌。[0026]与现有技术相比,本发明的技术方案具有以下优点:[0027]首先,本发明证实了以LRPPRC为靶点能够有效治疗肿瘤或癌症。特别是本发明设计筛选的LRPPRC特异性核酸适配体R14单独使用时即可以浓度依赖的方式显著抑制肺癌细胞的生长。[0028]其次,本发明通过LRPPRC特异性核酸适配体R14弥补了SRC激酶抑制剂敏感性低、易耐药的缺点,增强了肿瘤治疗效果。本发明利用了核酸适体药物高特异性、容易合成和修饰、无免疫原性、良好的组织渗透性等优点,利用LRPPR核酸适配体R14通过阻断LRPPRC的正常组织功能干扰细胞周期进展,抑制肿瘤细胞增殖,从而显著增加了肿瘤细胞对传统SRC激酶抑制剂的敏感性,大大增强了对肿瘤的杀伤效果。[0029]最后,本发明通过SRC激酶抑制剂避免了LRPPRC特异性核酸适配体R14导致的SRC激酶活性异常激活。本发明研究发现LRPPRC特异性核酸适配体长时间单独使用可能激活与细胞存活相关的SRC激酶活性,通过组合使用SRC激酶抑制剂特异性的逆转这种由LRPPRC特异性核酸适配体导致的异常激活的SRC激酶活性。附图说明[0030]通过阅读下文优选实施方式的详细描述,各种其他的优点和益处对于本领域普通技术人员将变得清楚明了。附图仅用于示出优选实施方式的目的,而并不认为是对本发明的限制。而且在整个附图中,用相同的参考符号表示相同的部件。在附图中:[0031]图1为LRPPRC核酸适配体R14单药使用在体外对肿瘤细胞的抑制效果。[0032]空白对照PBS和无关对照40uMRTT的肿瘤细胞指数曲线斜率基本相同,而核酸适配体R14的斜率较小,并且R1440uMR1420uMR1410uMR145福。[0033]图2为LRPPRC核酸适配体R14联合SRC激酶抑制剂体外对肿瘤细胞的抑制效果。深色(蓝色表示将无关对照RTT与SCR激酶抑制剂联用的细胞增殖曲线;浅色红色表示将R14与SCR激酶抑制剂联用的细胞增殖曲线。[0034]a:5uMR14核酸适体增强达沙替尼对A549、A973的抑制作用;[0035]b:5uMR14核酸适体增强KX2-391对A549、A973的抑制作用;[0036]c:5yMR14核酸适体增强博舒替尼对A549、A973的抑制作用。[0037]图3为LRPPRC核酸适配体R14联合SRC激酶抑制剂小鼠体内对肿瘤细胞的抑制效果。[0038]a各治疗组肿瘤增长曲线;b各治疗组瘤体图片;C各治疗组瘤体重量统计;d各治疗组老鼠体重统计具体实施方式[0039]下面将参照附图更详细地描述本公开的示例性实施方式。虽然附图中显示了本公开的示例性实施方式,然而应当理解,可以以各种形式实现本公开而不应被这里阐述的实施方式所限制。相反,提供这些实施方式是为了能够更透彻地理解本公开,并且能够将本公开的范围完整的传达给本领域的技术人员。[0040]根据本发明的实施方式,提出以下实施例[0041]实施例1、核酸适体的合成及其预处理[0042]未经任何修饰的核酸适配体R14:5,-GGTGGGTGGGTTGGGTGG-3,(SEQIDN0:1,其中G、T分别代表未经修饰的鸟嘌呤、胸腺嘧啶)。由仙34〇〇DNA合成仪合成,合成的DNA经HpLC纯化、真空千燥、80%醋酸去除DMT、乙醇沉淀和真空千燥、用Tris—HC1pH9.0调节pH至7•〇,过滤灭菌后,最终用无菌的D-PBS稀释至500uM,于-2TC保存备用。[0043]实施例2、核酸适体R14体外对A549、A973细胞的生长[0044]A549细胞级A973细胞经胰酶-EDTA处理和离心后,按以2〇〇〇细胞孔的密度种植于xCELLigenceRTCAMP系统无标记细胞功能分析伩96孔板中培养24h。更换含有LRPPRC特异性核酸适配体R14的新鲜培养基,浓度梯度为5141、10_,20處、40虚,或阴性对照序列1?1'1'40UM,培养24h。每组处理均设置6组平行实验。培养检测,绘制细胞生长速率曲线,结果见图1。实验表明核酸适体R14能够在体外能显著抑制肺癌A549、A973的生长且呈浓度梯度依赖效应。[0045]实施例3、核酸适体R14联合SRC激酶抑制剂体外对A549及A973细胞增殖的影响[0046]A549细胞及A973细胞经胰酶-EDTA处理和离心后,按以2〇〇〇细胞孔的密度种植于xCELLigenceRTCAMP系统无标记细胞功能分析伩96孔板中培养24h。更换含有LRPPRC特异性核酸适配体R14或无关对照序列的新鲜培养基,浓度为5uM,培养24h。添加对应SRC激酶抑制剂,继续培养检测,每组处理均设置6组平行实验,结果见图2。实验表明5uM核酸适体R14能够在体外明显增加肺癌A549、A973对SRC激酶的敏感性,两者联合可以有效杀伤肿瘤细胞。[0047]实施例4、LRPPRC核酸适体联合SRC激酶抑制剂体内对A549细胞增殖的影响[0048]实施方案3:200万A549细胞进行裸鼠皮下注射成瘤,瘤体直径到达〇.3cm时,进行核酸适配体R14与SRC激酶抑制剂达沙替尼给药。R14采取瘤内注射形式给药,每次10如11〇iigmL。达沙替尼采取腹腔注射给药,给药量4〇mgKg。每三天给药一次,结果见图3。实验结果表明核酸适体R14能在小鼠体内抑制肿瘤的生长,但是对小鼠体重没有明显影响,不具有明显的毒副作用。并且R14与达沙替尼的联合使用具有更好的肿瘤抑制效果。[0049]以上所述,仅为本发明较佳的具体实施方式,但本发明的保护范围并不局限于此,任何熟悉本技术领域的技术人员在本发明揭露的技术范围内,可轻易想到的变化或替换,都应涵盖在本发明的保护范围之内。因此,本发明的保护范围应以所述权利要求的保护范围为准。

权利要求:1.一种LRPPRC特异性核酸适配体,其包含:aSEQIDNO:1所示序列的核酸;或⑹在SEQIDNO:1所示序列的基础上缺失、取代、添加、插入一个或几个核苷酸,且具有与LRPPRC特异性结合的功能。2.如权利要求1所述LRPPRC特异性核酸适配体,其特征在于所述核酸适配体还包含选自下组的一种或多种修饰:a所述核酸适体中的一个或多个碱基用天然或人工合成的修饰碱基替代;⑹所述核酸适体的骨架被修饰为硫代磷酸酯骨架;c所述核酸适体被修饰为肽核酸;d所述核酸适体用聚乙二醇修饰;所述核酸适配体的修饰不改变其特异性结合LRPPRC的功能。3.—种药物组合物,其包含权利要求1或2所述LRPPRC特异性核酸适配体。4.如权利要求3所述药物组合物,其特征在于所述药物组合物还包含SRC激酶抑制剂。5.如权利要求4所述药物组合物,其特征在于所述SRC激酶抑制剂包括达沙替尼、博舒替尼、或KX2-391等。6.权利要求1-2所述LRPPRC特异性核酸适配体在制备治疗肿瘤药物中的用途。7.如权利要求6所述的用途,其特征在于所述LRPPRC特异性核酸适配体单独、或与SRC激酶抑制剂联合用于制备治疗肿瘤药物。8.权利要求1-2所述LRPPRC特异性核酸适配体在制备用于增强SRC激酶抑制剂肿瘤抑制活性中的用途。9.如权利要求7或8所述的用途,其特征在于所述SRC激酶抑制剂包括达沙替尼、博舒替尼、KX2-391等。10.如权利要求6_9所述的用途,其特征在于所述肿瘤为肺癌,特别是非小细胞肺癌和肺腺癌。

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