申请/专利权人：中国林业科学研究院亚热带林业研究所

申请日：2020-05-22

公开（公告）日：2020-07-28

公开（公告）号：CN111455091A

主分类号：C12Q1/6895(20180101)

分类号：C12Q1/6895(20180101);C12N15/11(20060101)

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2023.05.12#授权;2020.08.21#实质审查的生效;2020.07.28#公开

摘要：本发明提供与油茶种仁油中亚麻酸含量相关的SNP分子标记及其应用。所述分子标记是与油茶油脂中亚麻酸含量显著关联的47个SNP标记，这些标记位于油茶的30个转录本内。本发明提供的SNP标记位置明确，检测方法方便快速，不受环境影响，目的性更强，工作量小，效率更高，成本低。通过检测这些SNP位点，可在苗期进行鉴定和辅助筛选，大大节约生产成本和提高选择效率。利用本发明的分子标记进行高亚麻酸含量油茶育种，可提高油茶育种的选择效率，加快育种进程。

主权项：1.与油茶种仁油中亚麻酸含量相关的SNP分子标记，其特征在于，所述分子标记选自PB.102493.1-527、PB.103936.1-364、PB.10862.1-1402、PB.14705.1-426、PB.18953.1-793、PB.22228.2-2299、PB.24874.2-147、PB.26169.1-190、PB.28575.1-517、PB.34783.2-2214、PB.35363.2-2268、PB.3873.1-32、PB.46307.1-770、PB.47164.1-980、PB.50731.1-672、PB.50731.1-680、PB.5358.1-2661、PB.54042.1-2426、PB.54042.1-2477、PB.57367.1-207、PB.63477.1-1109、PB.63477.1-1163、PB.63477.1-1166、PB.67182.2-1418、PB.67876.1-630、PB.70158.1-1025、PB.70158.1-187、PB.70158.1-306、PB.70158.1-314、PB.70158.1-408、PB.70158.1-413、PB.70158.1-473、PB.70158.1-649、PB.70158.1-704、PB.70158.1-707、PB.70158.1-778、PB.70158.1-854、PB.70158.1-930、PB.70158.1-935、PB.73485.1-510、PB.76712.1-959、PB.78861.1-470、PB.80962.1-1163、PB.8223.1-569、PB.8694.1-1090、PB.96124.1-1263和PB.9959.4-583中的任一个；其中，标记PB.102493.1-527含有油茶如SEQIDNO:61所示序列第527bp处的多态性为TC的核苷酸序列；标记PB.103936.1-364含有油茶如SEQIDNO:62所示序列第364bp处的多态性为GT的核苷酸序列；标记PB.10862.1-1402含有油茶如SEQIDNO:63所示序列第1402bp处的多态性为CT的核苷酸序列；标记PB.14705.1-426含有油茶如SEQIDNO:64所示序列第426bp处的多态性为AG的核苷酸序列；标记PB.18953.1-793含有油茶如SEQIDNO:65所示序列第793bp处的多态性为TC的核苷酸序列；标记PB.22228.2-2299含有油茶如SEQIDNO:66所示序列第2299bp处的多态性为CT的核苷酸序列；标记PB.24874.2-147含有油茶如SEQIDNO:67所示序列第147bp处的多态性为GA的核苷酸序列；标记PB.26169.1-190含有油茶如SEQIDNO:68所示序列第190bp处的多态性为TC的核苷酸序列；标记PB.28575.1-517含有油茶如SEQIDNO:69所示序列第517bp处的多态性为GA的核苷酸序列；标记PB.34783.2-2214含有油茶如SEQIDNO:70所示序列第2214bp处的多态性为TC的核苷酸序列；标记PB.35363.2-2268含有油茶如SEQIDNO:71所示序列第2268bp处的多态性为AC的核苷酸序列；标记PB.3873.1-32含有油茶如SEQIDNO:72所示序列第32bp处的多态性为GA的核苷酸序列；标记PB.46307.1-770含有油茶如SEQIDNO:73所示序列第770bp处的多态性为AC的核苷酸序列；标记PB.47164.1-980含有油茶如SEQIDNO:74所示序列第980bp处的多态性为GT的核苷酸序列；标记PB.50731.1-672含有油茶如SEQIDNO:75所示序列第672bp处的多态性为CT的核苷酸序列；标记PB.50731.1-680含有油茶如SEQIDNO:75所示序列第680bp处的多态性为AG的核苷酸序列；标记PB.5358.1-2661含有油茶如SEQIDNO:76所示序列第2661bp处的多态性为AC的核苷酸序列；标记PB.54042.1-2426含有油茶如SEQIDNO:77所示序列第2426bp处的多态性为TC的核苷酸序列；标记PB.54042.1-2477含有油茶如SEQIDNO:77所示序列第2477bp处的多态性为GT的核苷酸序列；标记PB.57367.1-207含有油茶如SEQIDNO:78所示序列第207bp处的多态性为GC的核苷酸序列；标记PB.63477.1-1109含有油茶如SEQIDNO:79所示序列第1109bp处的多态性为AG的核苷酸序列；标记PB.63477.1-1163含有油茶如SEQIDNO:79所示序列第1163bp处的多态性为GA的核苷酸序列；标记PB.63477.1-1166含有油茶如SEQIDNO:79所示序列第1166bp处的多态性为AC的核苷酸序列；标记PB.67182.2-1418含有油茶如SEQIDNO:80所示序列第1418bp处的多态性为AG的核苷酸序列；标记PB.67876.1-630含有油茶如SEQIDNO:81所示序列第630bp处的多态性为CT的核苷酸序列；标记PB.70158.1-1025含有油茶如SEQIDNO:82所示序列第1025bp处的多态性为CT的核苷酸序列；标记PB.70158.1-187含有油茶如SEQIDNO:82所示序列第187bp处的多态性为AG的核苷酸序列；标记PB.70158.1-306含有油茶如SEQIDNO:82所示序列第306bp处的多态性为CT的核苷酸序列；标记PB.70158.1-314含有油茶如SEQIDNO:82所示序列第314bp处的多态性为AG的核苷酸序列；标记PB.70158.1-408含有油茶如SEQIDNO:82所示序列第408bp处的多态性为TG的核苷酸序列；标记PB.70158.1-413含有油茶如SEQIDNO:82所示序列第413bp处的多态性为TA的核苷酸序列；标记PB.70158.1-473含有油茶如SEQIDNO:82所示序列第473bp处的多态性为CG的核苷酸序列；标记PB.70158.1-649含有油茶如SEQIDNO:82所示序列第649bp处的多态性为AG的核苷酸序列；标记PB.70158.1-704含有油茶如SEQIDNO:82所示序列第704bp处的多态性为GA的核苷酸序列；标记PB.70158.1-707含有油茶如SEQIDNO:82所示序列第707bp处的多态性为AC的核苷酸序列；标记PB.70158.1-778含有油茶如SEQIDNO:82所示序列第778bp处的多态性为CT的核苷酸序列；标记PB.70158.1-854含有油茶如SEQIDNO:82所示序列第854bp处的多态性为AC的核苷酸序列；标记PB.70158.1-930含有油茶如SEQIDNO:82所示序列第930bp处的多态性为CG的核苷酸序列；标记PB.70158.1-935含有油茶如SEQIDNO:82所示序列第935bp处的多态性为TG的核苷酸序列；标记PB.73485.1-510含有油茶如SEQIDNO:83所示序列第510bp处的多态性为CG的核苷酸序列；标记PB.76712.1-959含有油茶如SEQIDNO:84所示序列第959bp处的多态性为TC的核苷酸序列；标记PB.78861.1-470含有油茶如SEQIDNO:85所示序列第470bp处的多态性为TC的核苷酸序列；标记PB.80962.1-1163含有油茶如SEQIDNO:86所示序列第1163bp处的多态性为TC的核苷酸序列；标记PB.8223.1-569含有油茶如SEQIDNO:87所示序列第569bp处的多态性为TA的核苷酸序列；标记PB.8694.1-1090含有油茶如SEQIDNO:88所示序列第1090bp处的多态性为TC的核苷酸序列；标记PB.96124.1-1263含有油茶如SEQIDNO:89所示序列第1263bp处的多态性为TC的核苷酸序列；标记PB.9959.4-583含有油茶如SEQIDNO:90所示序列第583bp处的多态性为TC的核苷酸序列。

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百度查询： 中国林业科学研究院亚热带林业研究所 与油茶种仁油中亚麻酸含量相关的SNP分子标记及其应用

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