申请/专利权人：中南大学

申请日：2020-12-29

公开（公告）日：2021-04-27

公开（公告）号：CN112712850A

主分类号：G16B15/00(20190101)

分类号：G16B15/00(20190101);G16B20/30(20190101);G16B25/00(20190101)

优先权：

专利状态码：失效-发明专利申请公布后的驳回

法律状态：2024.03.22#发明专利申请公布后的驳回;2021.05.14#实质审查的生效;2021.04.27#公开

摘要：本发明涉及一种可应用于传染病病原体测序读段映射的种子序列定位方法。该方法包括如下步骤：1预设种子长度：将种子长度N预先设定为某个值；2为参考基因组建立二叉树索引；3在二叉树索引上定位：在二叉树索引上对每个读段进行种子序列定位，其中对于每个读段其定位方法是：对读段中每个长为N的片段，都在二叉树索引上查找。相比现有技术本发明提供的种子序列定位方法计算量极大减少。

主权项：1.一种测序读段过程中种子序列定位方法，其包括如下步骤：1预设种子长度：将种子长度N预先设定为某个值；2为参考基因组建立二叉树索引；3在二叉树索引上定位：在二叉树索引上对每个读段进行种子序列定位，其中对于每个读段其定位方法是：对读段中每个长为N的片段，都在二叉树索引上查找。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 中南大学 一种可应用于传染病病原体测序读段映射的种子序列定位方法

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