申请/专利权人：南京医基云医疗数据研究院有限公司

申请日：2021-06-30

公开（公告）日：2024-04-23

公开（公告）号：CN113327646B

主分类号：G16B30/10

分类号：G16B30/10;G16B15/00

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.04.23#授权;2021.09.17#实质审查的生效;2021.08.31#公开

摘要：本公开是关于一种测序序列的处理方法及装置、存储介质、电子设备，涉及基因测序技术领域，该方法包括：根据目标病毒参考基因组序列、其他近源病毒参考基因组序以及目标病毒的宿主参考基因组序列，列构建目标参考基因组序列；将待处理测序序列比对到目标参考基因组序列中，得到比对结果，并对比对到目标病毒参考基因组序列上的待处理测序序列进行排序，得到排序结果；根据排序结果以及比对结果计算待处理测序序列的唯一比对数据；根据唯一比对数据计算待处理测序序列在不同测序深度下，在目标病毒参考基因组序列中的覆盖比例，并根据覆盖比例确定与待处理测序序列对应的目标对象是否为确诊患者。本公开提高了测序序列的处理效率。

主权项：1.一种测序序列的处理方法，其特征在于，包括：根据目标病毒参考基因组序列、与所述目标病毒参考组基因序列对应的其他近源病毒参考基因组序列以及所述目标病毒的宿主参考基因组序列，构建目标参考基因组序列；基于预设的比对算法，将待处理测序序列分别比对到所述目标参考基因组序列中的目标病毒参考基因组序列、宿主参考基因组序列以及其他近源病毒参考基因组序列中，得到第一子比对结果、第二子比对结果以及第三子比对结果；根据所述第一子比对结果、第二子比对结果以及第三子比对结果，生成所述比对结果，并对比对到所述目标病毒参考基因组序列上的待处理测序序列进行排序，得到排序结果；根据所述比对结果，判断所述待处理测序序列的测序读长是否被唯一比对到所述目标病毒参考基因组序列上；若是，则在所述排序结果中对所述测序读长的标识进行匹配，并根据匹配结果生成所述目标测序序列的唯一比对数据；根据所述唯一比对数据计算所述待处理测序序列在不同测序深度下，在所述目标病毒参考基因组序列中所覆盖的位点数目之和；根据位点数目之和以及所述目标病毒参考基因组序列的序列长度，计算所述待处理测序序列在目标病毒参考基因组序列中的覆盖比例。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 南京医基云医疗数据研究院有限公司 测序序列的处理方法及装置、存储介质、电子设备

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