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【发明授权】一种基于物种COI基因的吸血蠓寄主鉴定方法_遵义医科大学_202010199546.X 

申请/专利权人:遵义医科大学

申请日:2020-03-20

公开(公告)日:2022-10-28

公开(公告)号:CN111172298B

主分类号:C12Q1/6888

分类号:C12Q1/6888;C12Q1/686

优先权:

专利状态码:有效-授权

法律状态:2022.10.28#授权;2020.06.12#实质审查的生效;2020.05.19#公开

摘要:一种基于物种COI基因的吸血蠓寄主鉴定方法,含有12种常见寄主动物COI基因的扩增引物,通过提取吸血蠓饱血腹部的血液基因组DNA,采用不同引物进行PCR扩增,再根据扩增产物大小鉴定出相应的寄主。本申请提供扩增12种常见寄主动物COI基因的扩增引物及寄主鉴定方法,有利于实现吸血蠓常见寄主的快速、准确鉴定,降低物种鉴定成本。

主权项:1.一种基于物种COI基因的吸血蠓寄主鉴定方法,含有12种常见寄主动物COI基因的特异性扩增引物,引物序列及其扩增片段长度如下:a、人的COI基因的特异性扩增引物,上游引物:5’CAATACCAAACGCCCCTCTTC3’;下游引物:5’AGGTTTATGGAGGGTTCTTCTAC3’;扩增片段长度为:944bp;b、牛的COI基因的特异性扩增引物,上游引物:5’TGAATTAGGCCAACCCGGAA3’;下游引物:5’GTCGACGTCTATTCCGACAGT3’;扩增片段长度为:784bp;C、羊的COI基因的特异性扩增引物,上游引物:5’CAACCCGGAACCCTACTTGG3’;下游引物:5’ATGCCTGCTAGGTGTAGGGA3’;扩增片段长度为:338bp;d、鸭的COI基因的特异性扩增引物,上游引物:5’CCCGACATAGCATTCCCACG3’;下游引物:5’CGTGTAGGGTGGCGAGTCAG3’;扩增片段长度为:718bp;e、狗的COI基因的特异性扩增引物,上游引物:5’ACTAGGTCAGCCCGGTACTT3’;下游引物:5’CAGTGGGCAAATCCTCCCAT3’;扩增片段长度为:1068bp;f、猪的COI基因的特异性扩增引物,上游引物:5’TCACCCGCAATACTATGAGCTCTG3’;下游引物:5’TGATAGGGAGGAGGACATCCG3’;扩增片段长度为:506bp;g、鼠的COI基因的特异性扩增引物,上游引物:5’GCTAGCCGCAGGCATTACTA3’;下游引物:5’TGGGTGCCCAAAGAATCAGA3’;扩增片段长度为:121bp;h、马的COI基因的特异性扩增引物,上游引物:5’ACCACAAAGACATCGGCACT3’;下游引物:5’AATCGAGGACACCCCAGCTA3’;扩增片段长度为:443bp;i、兔的COI基因的特异性扩增引物,上游引物:5’GCAGGAGGAGGAGACCCTAT3’;下游引物:5’TAGTCTGAGTACCGTCGGGG3’;扩增片段长度为:662bp;j、猫的COI基因的特异性扩增引物,上游引物:5’GGGCCAACCTGGTACACTAC3’;下游引物:5’ATTCCGGACAGGCCTAGGAA3’;扩增片段长度为:1185bp;k、鹿的COI基因的特异性扩增引物,上游引物:5’TACAGTCGGAGGCTTAACCG3’;下游引物:5’GGATGCAAACGCTTCTCAG3’;扩增片段长度为:391bp;l、鸡的COI基因的特异性扩增引物,上游引物:5’CTTCGGTCACCCCGAAGTTT3’;下游引物:5’CCAGTTGGGATGGCGATGAT3’;扩增片段长度为:240bp;所述鉴定方法包括以下步骤:步骤1:将吸血蠓饱血腹部内容物分离出来,用于提取基因组DNA;步骤2:以基因组DNA为模板,分别加入12种常见寄主动物COI基因的特异性扩增引物进行PCR扩增,PCR反应体系如下;2×EsTaqMasterMix4.5μL;引物p1(100pmolL)0.2μL;引物p2(100pmolL)0.2μL;模板DNA1μL;ddH2O6.6μL;总体积12.5μL;反应条件为:95℃预变性5min,1个循环;94℃变性30sec,牛、羊、人53℃,鸭、鼠、鹿54℃,狗、马、兔、猫、鸡55℃,猪56℃,退火30sec,72℃延伸30sec,35个循环;72℃延伸10min,1个循环;最后16℃,保存;步骤3:取出一定量的PCR扩增产物,通过琼脂糖凝胶电泳分离,与DNAMarker电泳条带进行比对判断出扩增条带的大小,即人944bp、牛784bp、羊338bp、鸭718bp、狗1068bp、猪506bp、鼠121bp、马443bp、兔662bp、猫1185bp、鹿391bp、鸡240bp;步骤4:最后,根据PCR扩增产物与Marker电泳条带的对比结果,即可判断待测的蠓虫腹部血粉属于哪一物种即对应的寄主。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 遵义医科大学 一种基于物种COI基因的吸血蠓寄主鉴定方法

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