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【发明授权】基于机器学习的重叠染色体识别和分割方法_北京航空航天大学_202010962405.9 

申请/专利权人:北京航空航天大学

申请日:2020-09-14

公开(公告)日:2023-01-06

公开(公告)号:CN112215800B

主分类号:G06T7/00

分类号:G06T7/00;G06T7/12;G06T7/181;G06T5/00;G06V10/764

优先权:

专利状态码:有效-授权

法律状态:2023.01.06#授权;2021.01.29#实质审查的生效;2021.01.12#公开

摘要:本发明公开了一种基于机器学习的重叠染色体识别和分割方法,主要包括如下部分:首先通过图像预处理方法自动获取染色体轮廓,提取染色体轮廓的关键特征;基于重叠黏连和单个染色体的标注,训练支持向量机分类器,判别重叠黏连染色体和单个染色体;使用图像处理方法进行重叠黏连染色体分割,获得单个染色体。本发明结合现代图像处理技术和机器学习算法,采用区分重叠和单个染色体的标注方法,不仅提高了重叠染色体识别和分割的准确率,而且节省了大量人工标注成本。

主权项:1.基于机器学习的重叠染色体识别和分割方法,其特征在于,包括以下步骤:针对染色体核型图像进行数据采集,对采集后的所述染色体核型图像进行预处理操作,对预处理后的所述染色体核型图像自动获取染色体轮廓;对所述自动获取的染色体轮廓提取基于轮廓的关键特征;所述对预处理后的所述染色体核型图像提取染色体轮廓的关键特征,包括:将所获得染色体轮廓形状拟合成椭圆,计算椭圆短轴长度和长轴长度的比值;将所获得染色体轮廓形状拟合成凸包,计算闭合轮廓的面积和凸包面积的比值;将所获得染色体轮廓形状拟合成多边形,记录多边形的边数;通过上述方法获得染色体轮廓的三种关键特征;采用所述染色体轮廓图像提取的关键特征训练支持向量机分类器,将染色体识别为重叠黏连染色体和单个染色体;针对所述识别为重叠黏连染色体,通过寻找凹点和图像分割方法,经过重复分割操作,获得多个新的单个染色体图像;所述针对所述识别为重叠黏连染色体,通过寻找凹点和图像分割方法,经过重复分割操作,获得多个新的单个染色体图像,包括:获取染色体轮廓的近似凸包,计算凸包的每边到染色体轮廓的距离,将距离最大的两点作为切割的凹点,通过绘制消锯齿的直线,达到分割轮廓的目的,对分割后的轮廓重复上述操作,从重叠黏连染色体中获得多个单个染色体图像;针对所述识别为单个染色体,经过旋转和填充背景后,获得单个染色体图像;所述针对所述识别为单个染色体,经过旋转和填充背景后,获得单个染色体图像,包括:计算染色体轮廓的近似矩形包,根据矩形的长宽比确定旋转的近似角度,将单个染色体旋转特定角度,产生的空白部分用黑色填充,获得单个染色体图像。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 北京航空航天大学 基于机器学习的重叠染色体识别和分割方法

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