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【发明授权】基于文字辅助的半监督3D医学图像分割方法_中国海洋大学_202410096489.0 

申请/专利权人:中国海洋大学

申请日:2024-01-24

公开(公告)日:2024-04-23

公开(公告)号:CN117611601B

主分类号:G06T7/10

分类号:G06T7/10;G06T7/00;G06N3/0895;G06N3/088;G06N3/0464

优先权:

专利状态码:有效-授权

法律状态:2024.04.23#授权;2024.03.15#实质审查的生效;2024.02.27#公开

摘要:本发明公开了一种基于文字辅助的半监督3D医学图像分割方法,属于医学图像处理技术领域。本发明在基于文字辅助正交注释的“几乎无监督”3D医学图像分割的时候,考虑到了整个过程中应最大化的减少人工标注的工作,降低相邻切片注释的冗余性,充分利用体积图片不同视角所带来的视差可以互相弥补的优势。克服两分支交叉监督是“非此即彼”的范式,引入了更多的惩罚因素,使得交叉伪监督的效果更好。本发明对减轻训练3D医学图像分割中所需要复杂的注释工作具有重要意义,为如何使用文本来指导3D医学分割的工作提供了一个新方向。

主权项:1.一种基于文字辅助的半监督3D医学图像分割方法,其特征在于,包括如下步骤:S1:收集3D医学图像数据建立数据集,并对图像数据进行预处理;将数据集分为训练集和测试集,所述训练集包括有监督的图像数据和无监督的图像数据;S2:利用大型视觉语言模型CLIP的文本编码器,对所选数据集的文本描述进行编码从而获得文本特征;使用大型视觉语言模型CLIP的文本编码器来对文本描述进行特征提取,如公式1所示:Te=Ftt1:其中Te代表提取到的特征向量,Ft代表文本编码器,t代表器官的文本描述;S3:构建网络模型,包括三个分支,分别是分割网络分割网络分割网络该分割网络结构均为VNet;S4:构造权重矩阵,对于有监督的图像,将其对应的真实标签分割乘上权重矩阵得到稀疏正交注释的标签;对于所构建训练集体积图像Dtr,其中Xi的标签Yi,i表示第i幅图像,根据视角不同将其拆分成一系列切片;如下式2、3、4所示: 其中a、b、c分别代表不同的视角,m、n、p则分别代表沿着a视角将Yi分成m个切片,沿b视角将Yi分成n个切片,沿c视角将Yi分成p个切片;i表示当前是第i个体积图像;以第一个分支为例,只需构造一个与Yi大小相同的全零矩阵Wa,此时Wa是一个3D矩阵,在第一与第二个维度上设置某一个切片的值为1,如公式5、公式6所示:Wa[:,k,:]=15;Wa[j,:,:]=16;公式5表示沿b视角,将第k张切片,也即是切片的值设置为1,公式6表示沿a视角,将第j张切片,也即是切片的值设置为1;然后第一个分支的有监督图像的稀疏标签通过下式7计算得到: 对于第二个分支和第三个分支的稀疏标签同理可得,通过构造全零矩阵Wb和Wc;首先设置Wb[j,:,:]=1,表示沿着a视角,将第j张切片,也即是切片的值设置为1,Wb[:,:,q]=1,表示沿着c视角,将第q张切片,也即是切片的值设置为1,通过得到第二个分支的稀疏标签设置Wc[:,k,:]=1,表示沿着b视角,将第k张切片,也即是切片的值设置为1,Wc[:,:,q]=1,表示沿着c视角,将第q张切片,也即是切片的值设置为1,通过得到第三个分支的稀疏标签基于上述步骤,三个分支分别对应的稀疏正交注释构造完毕,用于后续的监督训练;S5:将训练集输入所述网络模型后,对于每个分支提取到的图像特征与已经获取的文本特征进行拼接,然后将其作为参数添加在后续操作当中作为指导得到分割结果;输入图像首先经过分割网络编码器得到图像特征,如公式8所示: 其中Xi表示此时第i个图像输入网络,为分割网络的编码器部分,则是提取到的图像特征;由于此时特征图的大小与之前得到的文本特征Te的大小不一致,所以将其经过全局平均池化之后才能与Te拼接,得到中间参数,如公式9所示: 其中GAP表示全局平均池化操作,Concat·,·表示向量拼贴操作,θi是待处理的中间参数变量;而对于编码器得到的图像特征继续经过解码器的上采样部分,将特征图还原成原始图片的大小,并且与经过处理的θi相加,将相加的结果再经过卷积操作,得到最终的预测掩码,如下式10所示: 其中表示分割网络的解码器部分,Conv·表示卷积操作,目的是使θi的通道数和经解码器过后得到的特征图的通道数相一致,Expand·是扩充操作,使得θi的大小经解码器过后得到的特征图的大小相一致,Conv是得到最终分割结果的卷积层;上述步骤是一个分支的处理过程,其余两分支的过程相同;S6:构造整个过程中的损失函数,包括利用稀疏正交注释的有监督部分的损失函数,以及无监督图像两两之间的交叉伪监督损失,以及将两者结合起来的总损失函数;S7:利用训练集对所述网络模型进行训练,再使用测试数据对已经训练好的模型进行测试,输出图像分割结果。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 中国海洋大学 基于文字辅助的半监督3D医学图像分割方法

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