申请/专利权人:北京林业大学
申请日:2022-12-05
公开(公告)日:2023-04-21
公开(公告)号:CN115995269A
主分类号:G16B50/30
分类号:G16B50/30;G16B40/00
优先权:
专利状态码:在审-实质审查的生效
法律状态:2023.05.09#实质审查的生效;2023.04.21#公开
摘要:本发明提供了一种挖掘油松年龄相关基因的方法,属于基因工程技术领域,包括:构建不同年龄的油松茎段的转录组数据集,获得原始数据;分析差异表达基因;利用差异表达基因确定皮尔逊相关系数的分界值,通过PCC的分界值构建多个基因表达网络;对基因表达网络中的TF表达量进行单调性测绘,以确定种子基因;将种子基因进行BFS算法运算,获得多个时序层级基因表达网络模型;根据获得的时序层级基因表达网络模型中出现的核心连接点基因,作为油松年龄相关基因。本发明成功挖掘出与年龄性状密切相关的基因DAL35,为分析油松老化分子机制奠定了基础,也为改善油松老化现象提供了遗传资源和技术支持。
主权项:1.一种挖掘油松年龄相关基因的方法,其特征在于,包括以下步骤:1构建不同年龄的油松茎段的转录组数据集,获得原始数据;2分析差异表达的基因;3利用步骤2获得的差异表达基因确定皮尔逊相关系数的分界值,通过皮尔逊相关系数的分界值构建多个基因表达网络;4对基因表达网络中的转录因子表达量进行单调性测绘,以确定种子基因;5将步骤4得到的种子基因,进行BFS算法运算,获得多个时序层级基因表达网络模型;6根据步骤5获得的时序层级基因表达网络模型中出现的核心连接点基因,作为油松年龄相关基因。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 北京林业大学 一种挖掘油松年龄相关基因的方法
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