申请/专利权人：中国农业科学院棉花研究所;河南大学

申请日：2021-08-06

公开（公告）日：2023-05-23

公开（公告）号：CN113640080B

主分类号：G01N1/28

分类号：G01N1/28;G01N1/36;G01N1/34;G01N1/42;G01N1/30

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2023.05.23#授权;2021.11.30#实质审查的生效;2021.11.12#公开

摘要：本发明涉及植物空间转录组学领域，主要涉及到一种制备用于棉花胚珠空间转录组分析的切片的方法。所述方法包括步骤：将在冰上预冷后的OCT注入包埋盒，将新鲜棉花胚组织放入装有OCT的包埋盒中，再用OCT覆盖暴露的组织表面；OCT完全冻结后进行切片和制片。本发明方法利用新鲜组织快速低温包埋后切片，获得了结构清晰、完整的冰冻切片，并可用于空间转录组学，得到一个完整的组织样本中产生的全部转录组数据，能够定位和区分功能基因在特定的组织区域内表达情况。根据差异基因的表达情况分析调控细胞群命运、空间组织、集体生长的关键因子，空间基因表达模式的详细分析对于阐述植物发育过程中复杂的调控网络至关重要。

主权项：1.一种制备用于棉花胚珠空间转录组分析的切片的方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：1取新鲜棉花胚组织，修剪成合适大小的组织块，清洗干净并吸干水分，置于培养皿中；2将在冰上预冷后的OCT注入包埋盒，加入量不超包埋盒13，确认组织切片方向，使用镊子将新鲜组织放入装有OCT的包埋盒中，再用OCT覆盖暴露的组织表面，确认在组织附近没有气泡，立即将含有组织和OCT的包埋盒放在干冰上或-80℃冰箱中冷冻30min，直至OCT完全冻结，3切片：OCT完全冻结后进行切片，将样品托固定到冰冻切片机的预冷样品托持承器上，进行切片，切片厚度为8-10μm；冰冻切片机预冷至-20℃，样品托持承器温度预冷至-20℃,4制片：将切片平展于速冻台上，调整切片的角度，将切片贴在空间转录组专用的玻片上，得到用于棉花胚珠空间转录组分析的切片。

全文数据：

权利要求：

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