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【发明授权】一种用于五指山猪品种鉴定的SNPs分子标记组合及方法_海南省农业科学院畜牧兽医研究所_202310149988.7 

申请/专利权人:海南省农业科学院畜牧兽医研究所

申请日:2023-02-22

公开(公告)日:2023-10-10

公开(公告)号:CN116287301B

主分类号:C12Q1/6888

分类号:C12Q1/6888;C12Q1/6874;C12N15/11

优先权:

专利状态码:有效-授权

法律状态:2023.10.10#授权;2023.07.11#实质审查的生效;2023.06.23#公开

摘要:本发明公开一种用于五指山猪品种鉴定的SNPs分子标记组合,该分子标记组合仅需筛选出五指山猪2K个特异性位点,表现出性价比高的优势。本发明提供的一种用于五指山猪品种鉴定的方法,首先根据4个群体的全基因组重测序数据筛选五指山猪2K个特异性位点,然后采用液相芯片‑靶向捕获测序方法,在五指山猪和其它5个群体中验证,设置鉴定五指山猪群体的参数阈值。本发明提供的一种用于五指山猪品种鉴定的方法鉴定为五指山猪群体的概率最小约为94%,具有准确高效的优势。

主权项:1.一种用于五指山猪品种鉴定的方法,其特征在于,包括如下步骤:步骤一、通过说明书表1中编号1至编号2000所示的五指山猪2K个特异性位点来设计目标探针序列,合成探针SNPs;步骤二、采用液相芯片-靶向捕获测序技术检测五指山猪、杜洛克猪、豫西黑猪、湘西黑猪、大白猪和临高猪2K个目标SNPs位点;步骤三、对步骤二的测序结果进行群体遗传分析;步骤四、根据群体遗传分析结果设定鉴定五指山猪群体的阈值,判断五指山猪群体的概率,所述鉴定五指山猪群体阈值的标准为:群体观察杂合度≤0.062,群体多态性标记比例≤0.059,群体核苷酸多态性≤0.063,群体内遗传距离≤0.058。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 海南省农业科学院畜牧兽医研究所 一种用于五指山猪品种鉴定的SNPs分子标记组合及方法

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