申请/专利权人：水利部交通运输部国家能源局南京水利科学研究院

申请日：2020-09-30

公开（公告）日：2024-03-08

公开（公告）号：CN112126682B

主分类号：C12Q1/6869

分类号：C12Q1/6869

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.03.08#授权;2021.05.21#著录事项变更;2021.01.12#实质审查的生效;2020.12.25#公开

摘要：本发明公开了一种基于环境DNA的替代生境支流和目标鱼类确定方法，该方法首先在目标干流和支流中，设置若干采样点，在每个采样点分别采集水体样本以及渔获物捕捞；然后分别采用eDNA技术和形态学方法识别鱼类物种，判断结果是否一致，若一致，则根据eDNA技术得到的数据计算各支流与目标干流的群落组成相似性以及共有鱼类物种比例，选择数值最高的支流作为替代生境支流；选择目标干流中特有珍稀、且最具代表性、对水环境最敏感的鱼类物种作为替代生境支流适宜性研究的目标鱼类。本发明可以更准确的、自动化的确定替代生境支流和目标鱼类。

主权项：1.一种基于环境DNA的替代生境支流确定方法，其特征在于该方法包括：1根据目标干流的各支流流量规模，从中筛选出若干支流作为备选支流；2在目标干流和筛选出的每个支流中，设置若干采样点，在每个采样点分别进行多时段的水体样本采集以及渔获物捕捞；3汇总计算捕捞的渔获物，得到每个采样点的鱼类物种及对应的鱼类数量；4对所有水体样本进行DNA片段提取，并通过测序、分析和计算，得到每个采样点的鱼类物种及对应的DNA序列数量；5分别计算步骤3和步骤4得到的鱼类物种的一致性、鱼类物种检出频率的相关性以及鱼类物种数量的相关性，并判断是否均位于预设条件内，若是，则执行步骤6，若否，返回步骤2重新采集；6对所有采样点的DNA序列进行无度量多维排序，并经过相似性分析后得到每个支流与目标干流的群落组成相似性；7计算每个支流与目标干流的共有鱼类物种比例；8选择与目标干流的群落组成相似性以及共有鱼类物种比例最高的支流作为替代生境支流；步骤5具体包括：5.1按下式计算步骤3和步骤4得到的鱼类物种的一致性RA，并判断是否位于预设误差范围内； 式中，N是采样点数，M＝maxmx,me，mx,me分别是步骤3、步骤4得到的鱼类物种的种数，aij表示步骤3和步骤4在采样点i采集到鱼类物种j的一致性指标，若步骤3、步骤4都在采样点i采集到鱼类物种j或者都没有采集到鱼类物种j，则aij＝1，否则aij＝0；5.2计算步骤3得到的每个鱼类物种的检出频率，作为第一组数据，计算步骤4得到的每个鱼类物种的检出频率，作为第二组数据，采用线性回归模型对两组数据进行相关性分析，判断两组数据是否呈显著的正相关；5.3计算步骤3得到的每个采样点检出的鱼类物种的种数，作为第一组数据，计算步骤4得到的每个采样点检出的鱼类物种的种数，作为第二组数据，采用线性回归模型对两组数据进行相关性分析，判断两组数据是否呈显著的正相关；5.4若步骤5.1～5.3的判断结果均为是，则执行步骤6，否则返回步骤2重新采集。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 水利部交通运输部国家能源局南京水利科学研究院 基于环境DNA的替代生境支流和目标鱼类确定方法

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