申请/专利权人：上海金匙医学检验实验室有限公司

申请日：2021-09-22

公开（公告）日：2024-03-08

公开（公告）号：CN113817804B

主分类号：C12Q1/6806

分类号：C12Q1/6806;C12Q1/6869;C40B50/06

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.03.08#授权;2022.01.07#实质审查的生效;2021.12.21#公开

摘要：本申请涉及一种测序文库自连接头消除方法及应用，所述方法以测序接头自连文库序列为靶序列，设计短序列guideDNA，结合Argonaute核酸内切酶实现dsDNA文库分子双链断裂，将自连接头从dsDNA文库分子上切除，从而阻止其在后续PCR反应中被扩增。该方法能够显著降低文库自连接头比例，增高测序cleanreads，提高数据有效率。

主权项：1.一种测序文库自连接头消除方法，其特征在于，所述方法包括如下步骤：1）设计针对测序文库自连接头序列的guideDNA；2）向待处理文库中添加guideDNA和Argonaute核酸内切酶，进行靶向酶切反应；3）去除体系中Argonaute核酸内切酶和guideDNA组分；所述步骤1）中设计针对测序文库的自连接头序列的guideDNA的方法为：以自连接头中两接头连接处两端相邻的各7-15bp序列为靶序列，设计正、反向guideDNA；所述guideDNA序列与自连接头序列互补；所述步骤2）中，所述Argonaute核酸内切酶为TtAgo；所述TtAgo酶和guideDNA的浓度比为1:3-10；所述靶向酶切反应条件为：70-80℃孵育30-40min，3-5℃冷却；所述guideDNA序列如SEQIDNO.1-2所示。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 上海金匙医学检验实验室有限公司 一种测序文库自连接头消除的方法及应用

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