申请/专利权人：昆明学院

申请日：2023-10-31

公开（公告）日：2024-03-12

公开（公告）号：CN117683861A

主分类号：C12Q1/686

分类号：C12Q1/686;C12Q1/6869;C12Q1/689;C12Q1/6895;C12Q1/04;C12Q1/18;C12N15/11;C12R1/01;C12R1/645;C12R1/80;C12R1/20;C12R1/07

优先权：

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2024.04.02#实质审查的生效;2024.03.12#公开

摘要：本发明属于微生物检测技术领域，公开了一种Pcc胁迫下魔芋及根际土壤微生物群落变化检测方法，魔芋组织内生微生物DNA提取、PCR扩增和测序；魔芋土壤微生物DNA提取、PCR扩增和测序；下机数据的质控与分析，原始测序序列使用Trimmomatic软件质控，用FLASH软件进行序列拼接；线性判别分析结合效应大小测量分析用于使用LEfSe软件搜索不同处理之间的统计学上不同的生物标志物，使用PICRUSt软件对各样本内生细菌群体进行功能预测。魔芋相关微生物群落动态的变化和组装参与了对Pcc胁迫的响应，A.muelleri倾向于招募更多的有益微生物来参与Pcc胁迫的应答。

主权项：1.一种Pcc胁迫下魔芋及根际土壤微生物群落变化检测方法，其特征在于，所述Pcc胁迫下魔芋及根际土壤微生物群落变化检测方法，包括以下步骤：第一步，魔芋组织内生微生物DNA提取、PCR扩增和测序；第二步，魔芋土壤微生物DNA提取、PCR扩增和测序；第三步，下机数据的质控与分析，原始测序序列使用Trimmomatic软件质控，用FLASH软件进行序列拼接；线性判别分析LDA结合效应大小测量LEfSe分析用于使用LEfSe软件搜索不同处理之间的统计学上不同的生物标志物，使用PICRUSt软件对各样本内生细菌群体进行功能预测。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 昆明学院 Pcc胁迫下魔芋及根际土壤微生物群落变化检测方法

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