申请/专利权人：深圳新锐基因科技有限公司

申请日：2023-04-17

公开（公告）日：2024-03-19

公开（公告）号：CN116486906B

主分类号：G16B20/50

分类号：G16B20/50;G16B20/30;G16B15/00

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.03.19#授权;2023.08.11#实质审查的生效;2023.07.25#公开

摘要：本申请涉及一种基于氨基酸残基突变提高蛋白质分子稳定性的方法、装置、设备及存储介质。该方法包括：获取目标蛋白分子的第一晶体结构；从第一晶体结构的氨基酸残基中筛选出非关键位点；对第一晶体结构进行自由能计算，并得到多个计算结果，多个计算结果包括目标蛋白分子的构象和自由能；比较多个计算结果的自由能，并将满足预置条件的构象作为目标蛋白分子的目标晶体结构；对目标晶体结构的非关键位点进行虚拟突变，并计算非关键位点的突变自由能；根据非关键位点的突变自由能，将满足突变条件的非关键位点作为突变位点；根据突变位点对目标蛋白分子进行突变以提高目标蛋白分子的稳定性。本申请提供的方案，能够提高蛋白质分子稳定性。

主权项：1.一种基于氨基酸残基突变提高蛋白质分子稳定性的方法，其特征在于，包括：获取目标蛋白分子的第一晶体结构，所述第一晶体结构为目标蛋白分子的单晶体结构；从所述第一晶体结构的氨基酸残基中筛选出非关键位点，包括：对所述第一晶体结构进行丙氨酸扫描，从所述第一晶体结构的氨基酸残基中筛选出满足第一预设条件的第一位点；根据所述目标蛋白分子的每个氨基酸残基在所述第一晶体结构和第二晶体结构中的第一溶剂可及表面积和第二溶剂可及表面积，从所述第一晶体结构的氨基酸残基中筛选出满足第二预设条件的第二位点；将所述第一位点和或所述第二位点作为关键位点，并将其余的氨基酸残基作为非关键位点；所述第二晶体结构指目标蛋白分子与其受体结合形成的复合物的晶体结构；对所述第一晶体结构进行自由能计算，并得到多个计算结果，所述多个计算结果包括目标蛋白分子的构象和自由能；比较所述多个计算结果的自由能，并将满足预置条件的构象作为所述目标蛋白分子的目标晶体结构；对所述目标晶体结构的所述非关键位点进行虚拟突变，并计算所述非关键位点的突变自由能，其中包括：分别利用第一预设算法和第二预设算法对所述目标晶体结构的所有所述非关键位点进行饱和突变扫描，并计算得到所有所述非关键位点的第一突变自由能变和第二突变自由能变；根据所述非关键位点的突变自由能，将满足突变条件的所述非关键位点作为突变位点，其中包括：将满足所述第一突变自由能变和所述第二突变自由能变均小于-0.5kcal·mol-1，且所述第一突变自由能变或所述第二突变自由能变小于-1kcal·mol-1的非关键位点作为突变位点；根据所述突变位点对所述目标蛋白分子进行突变以提高所述目标蛋白分子的稳定性。

全文数据：

权利要求：

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