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【发明授权】不结球白菜‘新夏青6号’指纹图谱的建立方法_上海市农业科学院_202210253858.3 

申请/专利权人:上海市农业科学院

申请日:2022-03-15

公开(公告)日:2024-03-19

公开(公告)号:CN115044694B

主分类号:C12Q1/6895

分类号:C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12Q1/6869;C12N15/11

优先权:

专利状态码:有效-授权

法律状态:2024.03.19#授权;2022.09.30#实质审查的生效;2022.09.13#公开

摘要:本发明实施例公开了不结球白菜新夏青6号指纹图谱的建立方法,属于白菜技术领域,本发明提供了30对SSR引物组成的标记组合,利用PCR扩增技术和毛细管电泳检测技术对‘新夏青6号’品种进行检测,可在短时间内完成‘新夏青6号’品种鉴定与遗传多样性评价工作,具有省时、高效、快速、准确、操作方便等优点。该不结球白菜‘新夏青6号’指纹图谱的建立方法,可对‘新夏青6号’品种真伪进行有效监控,从DNA水平揭示品种的遗传变异与遗传关系,保护了农作物品种,防止假冒伪劣产品进入市场。

主权项:1.一种不结球白菜‘新夏青6号’品种的鉴定方法,其特征在于,包括如下步骤:S1、提取待检‘新夏青6号’品种的DNA,以引物组合中的30对SSR引物对分别对待检‘新夏青6号’品种的DNA进行PCR扩增;S2、对扩增产物进行一代测序;S3、测序的同时进行检测,根据扩增产物的相对位置,通过对不同位点的数据整合,形成‘新夏青6号’及其亲本和‘苏州青’品种的SSR指纹图谱,扩增产物读带为无时,显性标记时记录为0;扩增条件为有时,显性标记记录为1;条带较弱或无法判断基因型时记录为是否正确,无效条带记录为--;共显性标记中纯合位点的等位变异大小数据记录为XX,扩增产物读带为纯合亲本1,其中X为该位点等位变异的大小;纯合位点的等位变异大小数据记录为YY,扩增产物读带为纯合亲本2,Y为该位点等位变异的大小;杂合位点的等位变异数据记录为XY,扩增产物为双亲带型,其中X、Y为该位点上两个不同的等位变异;条带较弱或无法判断基因型时记录为是否正确,无效等位变异的大小记录为--;上述“”前为小片段,“”后为大片段;其中,还包括引物编号-引物名称,引物编号-引物名称分别为SA000189-cnu_m139a、SA000190-nia_m086a、SA000191-nia_m098a、SA000192-nia_m138a、SA000193-cnu_m046a、SA000194-nia_m121a、SA000195-cnu_m073a、SA000196-cnu_m288a、SA000197-cnu_m316a、SA000198-cnu_m327a、SA000199-nia_m101a、SA000200-cnu_m252a、SA000201-Na10-D09、SA000202-cnu_m289a、SA000203-cnu_m442a、SA000204-cnu_m050a、SA000205-cnu_m149a、SA000206-nia_m037a、SA000207-nia_m049a、SA000208-cnu_m182a、SA000209-cnu_m295a、SA000210-cnu_m090a、SA000211-cnu_m537a、SA000212-cnu_m016a、SA000213-cnu_m530a、SA000214-cnu_m534a、SA000215-nia_m022a、SA000216-nia_m038a、SA000217-ENA2、SA000218-nia_m035a;引物组合由以下30对特异性引物对组成,其为SEQIDNO.1-2、SEQIDNO.3-4、SEQIDNO.5-6、SEQIDNO.7-8、SEQIDNO.9-10、SEQIDNO.11-12、SEQIDNO.13-14、SEQIDNO.15-16、SEQIDNO.17-18、SEQIDNO.19-20、SEQIDNO.21-22、SEQIDNO.23-24、SEQIDNO.25-26、SEQIDNO.27-28、SEQIDNO.29-30、SEQIDNO.31-32、SEQIDNO.33-34、SEQIDNO.35-36、SEQIDNO.37-38、SEQIDNO.39-40、SEQIDNO.41-42、SEQIDNO.43-44、SEQIDNO.45-46、SEQIDNO.47-48、SEQIDNO.49-50、SEQIDNO.51-52、SEQIDNO.53-54、SEQIDNO.55-56、SEQIDNO.57-58、SEQIDNO.59-60;所述‘新夏青6号’及其亲本和‘苏州青’的指纹图谱如下: 和 和 和 和 上述A1指代‘新夏青6号’亲本之一19-1P-603,B指代‘苏州青’,A2指代‘新夏青6号’亲本之二19-1P-604,C指代‘新夏青6号’。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 上海市农业科学院 不结球白菜‘新夏青6号’指纹图谱的建立方法

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