申请/专利权人：余珂

申请日：2019-12-31

公开（公告）日：2024-03-19

公开（公告）号：CN111161798B

主分类号：G16B20/00

分类号：G16B20/00;G16B30/20

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.03.19#授权;2020.09.04#实质审查的生效;2020.05.15#公开

摘要：本申请适用于生物信息技术领域，一种宏基因组的重组装方法、重组装装置及终端设备，包括：获取经过基因组装处理和宏基因组分箱处理后的初始基因组集合，所述初始基因组集合中包括多个微生物基因组；提取所述初始基因组集合中每个物种的非冗余基因组，其中，所述非冗余基因组为所属物种对应的目标基因个数最多的微生物基因组；对各个非冗余基因组分别进行重组装处理，得到重组装后的微生物基因组。通过上述方法，能够得到质量较高的微生物基因组，进而为后续的基因研究提供了可靠的研究对象。

主权项：1.一种宏基因组的重组装方法，其特征在于，包括：获取经过基因组装处理和宏基因组分箱处理后的初始基因组集合，所述初始基因组集合中包括多个微生物基因组；提取所述初始基因组集合中每个物种的非冗余基因组，其中，所述非冗余基因组为所属物种对应的目标基因个数最多的微生物基因组；对各个非冗余基因组分别进行重组装处理，得到重组装后的微生物基因组；所述提取所述初始基因组集合中每个物种的非冗余基因组，包括：提取每个第一集合中的每个物种的非冗余基因组，得到第二集合，所述第二集合包括从M个第一集合中提取的非冗余基因组，其中，M为基因组装方法的种类数；提取所述第二集合中的每个物种的非冗余基因组；对于所述第一集合和所述第二集合中的任一集合，提取所述集合中每个物种的非冗余基因组，包括：分别计算所述集合中每个微生物基因组的测序覆盖率，并根据所述测序覆盖率将所述集合中的各个微生物基因组划分为多个物种，每个物种包括K个微生物基因组；对于每个物种，当K＝1时，确定属于所述物种的一个微生物基因组为所述物种的非冗余基因组；当K1时，确定属于所述物种的K个微生物基因组中目标基因个数最多的微生物基因组为所述物种的非冗余基因组；若属于所述物种的K个微生物基因组中包括至少两个目标基因个数最多的微生物基因组，则从所述至少两个目标基因个数最多的微生物基因组中确定基因序列最长的微生物基因组为所述物种的非冗余基因组。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 余珂 宏基因组的重组装方法、重组装装置及终端设备

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