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【发明公布】一种电泳迁移率偏移校正的方法及系统_公安部第一研究所;北京中盾安民分析技术有限公司_202311623756.7 

申请/专利权人:公安部第一研究所;北京中盾安民分析技术有限公司

申请日:2023-11-30

公开(公告)日:2024-03-22

公开(公告)号:CN117743783A

主分类号:G06F18/20

分类号:G06F18/20;G01N27/447;G06F18/214

优先权:

专利状态码:在审-实质审查的生效

法律状态:2024.04.09#实质审查的生效;2024.03.22#公开

摘要:本发明公开了一种电泳迁移率偏移校正的方法及系统。该方法包括如下步骤:采集两板标准品DNA测序信号并处理;选取各自的高质量中段信号作为样本训练集和样本测试集;对样本训练集和样本测试集进行批量峰识别和动态规划,确定非标准通道信号的相对偏移参数值和目标函数的最优结果;将非标准通道信号的相对偏移参数值去平均值作为信号偏移的系统误差参数存储在DNA测序仪的信号系统中。本发明摆脱了全过程逐点自适应的计算模式,避免了校正模型在局部低质量信号段的适应性不佳问题,大大提升了计算效率。

主权项:1.一种电泳迁移率偏移校正的方法,其特征在于包括如下步骤:S1:设定一个信号通道为参照信号标准通道,将其余信号通道设定为非标准通道;S2:使用DNA测序仪批量采集至少两板标准品DNA测序信号;S3:将批量采集的两板标准品DNA测序信号分别进行去初始无用数据段、滤噪、去基线、归一化数据处理,得到处理后的两板数据;S4:在处理后的两板数据中选取各自的高质量中段信号,其中一部分的高质量中段信号作为样本训练集,另一部分的高质量中段信号作为样本测试集;S5:对样本训练集进行样本批量峰识别和动态规划,确定非标准通道信号的相对偏移参数值和目标函数的最优结果;S6:对非标准通道信号的相对偏移参数值取中值或平均值,并取整,将其作为样本训练集的电泳迁移率偏移参数值的训练结果;S7:对样本测试集进行样本批量峰识别和动态规划,确定样本测试集的电泳迁移率偏移参数值的训练结果;S8:将样本训练集的电泳迁移率偏移参数值的训练结果和样本测试集的电泳迁移率偏移参数值的训练结果取平均值并取整,将取整后的结果作为信号偏移的系统误差参数存储在DNA测序仪的信号系统中。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 公安部第一研究所;北京中盾安民分析技术有限公司 一种电泳迁移率偏移校正的方法及系统

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