申请/专利权人:普梭梅根公司
申请日:2018-09-07
公开(公告)日:2024-03-29
公开(公告)号:CN111315884B
主分类号:C12N15/10
分类号:C12N15/10;C12Q1/6806;C40B40/06;C12Q1/689
优先权:["20170908 US 62/555,782","20171106 US 62/582,162","20180514 US 62/671,410"]
专利状态码:有效-授权
法律状态:2024.03.29#授权;2020.09.25#实质审查的生效;2020.06.19#公开
摘要:诸如用于制备如下一代测序的测序用归一化的文库的方法和或系统的实施方式,可以包括以下一项或多项:生成一个或多个归一化的扩增子文库;生成一个或多个归一化的微生物群落相关联文库;和或生成与扩增子相关联测序和微生物群落相关联测序相关联的一个或多个归一化的组合序列文库。
主权项:1.一种用于制备归一化的组合文库的系统,所述系统包括:基于第一扩增过程、用与来自微生物群落的微生物相关联的至少一个样品的靶标分子,生成扩增子靶标分子集合的部件,其中所述靶标分子对应于与一个或多个扩增子生成引物的区域相关联的靶标集合;基于处理来自所述至少一个样品的总核酸生成微生物群落相关联片段集合的部件,其中所述微生物群落相关联片段集合包括宏基因组相关联核酸片段集合与宏转录组相关联核酸片段集合的至少之一;基于第二扩增过程、用所述扩增子靶标分子集合和微生物群落相关联片段集合,生成归一化的混合物的部件;和基于第三扩增过程、用所述归一化的混合物,生成包括测序就绪分子集合的所述归一化的组合文库的部件,其中所述测序就绪分子集合与所述靶标集合和所述微生物群落相关联,其中,所述测序就绪分子集合包括归一化的微生物群落相关联片段集合和归一化的扩增子靶标分子集合,所述归一化的微生物群落相关联片段集合用于改进在至少一个样品中初始表示的不同类型分子的量的均等化,且所述归一化的扩增子靶标分子集合用于降低扩增偏差,其中,所述归一化的组合文库用于同时扩增子相关联测序和微生物群落相关联测序;其中生成所述归一化的混合物包括基于所述第二扩增过程,用所述扩增子靶标分子集合、所述微生物群落相关联片段集合和基于归一化的引物集合,生成所述归一化的混合物,所述基于归一化的引物集合包括外部定义序列区域,其用于退火至所述扩增子靶标分子集合和所述微生物群落相关联片段集合。
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