申请/专利权人：新格元生物科技有限公司

申请日：2022-05-23

公开（公告）日：2024-04-09

公开（公告）号：CN117858955A

主分类号：C12Q1/6806

分类号：C12Q1/6806;C12Q1/6869

优先权：["20210524 US 63/192,432"]

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2024.04.26#实质审查的生效;2024.04.09#公开

摘要：本文的公开包括例如使用核酸测序从而确定细胞间相互作用的方法、系统、组合物和试剂盒。该方法可以将与多个细胞中的一个细胞相关联的细胞条形码序列与与多个分区中的一个分区相关联的细胞条形码序列相匹配，以识别所述细胞源自多个分区的哪个分区。在一些实施方案中，分区内一对相互作用的细胞附着有共同的细胞条形码。可以追踪具有共同细胞条形码的一对相互作用细胞的核酸序列至该对相互作用的细胞来源的分区，其中可以例如使用光学成像获得相互作用的细胞的表型可观察性，从而将细胞核酸序列如表达图谱与细胞功能和细胞间相互作用的性质联系起来。

主权项：1.一种确定参与感兴趣的细胞间相互作用的细胞的表达图谱的方法，包括：将多个第一细胞和多个第二细胞划分为多个分区；确定在所述多个分区的分区中的所述多个第一细胞中的一个第一细胞与所述多个第二细胞中的一个第二细胞之间的感兴趣的相互作用；将包括多个条形码分子的珠引入所述分区中，其中所述多个条形码分子的条形码分子包括相同的细胞条形码和不同的唯一分子标签UMI；使用所述多个条形码分子对与所述分区中的第一细胞和或第二细胞相关联的多个样本核酸进行条形码编码，以产生多个条形码编码核酸；汇集所述多个条形码编码核酸中的条形码编码核酸的第一子集，从而将所述多个条形码编码核酸中条形码编码核酸的第二子集保留在所述分区中；确定汇集的条形码编码核酸的序列；从所述汇集的条形码编码核酸的序列确定表达图谱；确定所述分区中保留的条形码编码核酸的相同细胞条形码的序列；将所述保留的条形码编码核酸的相同细胞条形码的序列和所述汇集的条形码编码核酸的序列中的相同细胞条形码的序列进行匹配；将所述第一细胞和或所述第二细胞的表达图谱确定为根据所述汇集的条形码编码核酸的序列确定的表达图谱；和将从所述汇集的条形码编码核酸的序列确定的所述第一细胞和或所述第二细胞的表达图谱与所述感兴趣的相互作用相匹配。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 新格元生物科技有限公司 确定细胞间相互作用的方法和系统

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