申请/专利权人：中国科学院上海药物研究所

申请日：2020-04-29

公开（公告）日：2024-04-23

公开（公告）号：CN113571124B

主分类号：G16B15/30

分类号：G16B15/30;G16B40/00

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.04.23#授权;2021.12.21#实质审查的生效;2021.10.29#公开

摘要：本发明公开了一种配体‑蛋白质相互作用的预测方法及装置，包括：对目标蛋白质的一级序列进行处理，获得由特征向量组成的若干蛋白质特征序列；基于目标配体的分子指纹图谱获取目标配体的若干原子特征序列；基于所述若干蛋白质特征序列以及所述若干原子特征序列利用预设的预测模型进行预测，获得所述目标蛋白质和所述目标配体相互作用的概率。本发明实施例中当需要预测某个蛋白质和某个配体能否进行相互作用时，只需要获得该蛋白质的各蛋白质特征序列以及该配体的原子特征序列，通过利用预测模型，就能预测出蛋白中哪些氨基酸片段能和配体中哪些原子进行相互作用，由此能够计算出该蛋白质和该配体相互作用的概率。

主权项：1.一种配体-蛋白质相互作用的预测方法，其特征在于，包括如下步骤：对目标蛋白质的一级序列进行处理，获得由特征向量组成的若干蛋白质特征序列；基于目标配体的分子指纹图谱获取目标配体的若干原子特征序列，a为分子的非氢原子数目；基于所述若干蛋白质特征序列以及所述若干原子特征序列利用预设的预测模型进行预测，获得所述目标蛋白质和所述目标配体相互作用的概率；所述预测模型至少基于自注意力机制获得若干样本序列的相互作用特征而配置，配置方式至少包括：采用自注意力机制对样本蛋白质的若干蛋白质特征序列以及样本配体的若干原子特征序列进行处理，经过Transformer解码器的学习，获得包含相互作用信息的维度为a×64的若干样本序列；利用计算公式 对所述若干样本序列进行计算，获得相互作用特征；其中是向量的模，是向量的权重，表示第i个相互作用特征序列，表示相互作用特征。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 中国科学院上海药物研究所 一种配体-蛋白质相互作用的预测方法及装置

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