申请/专利权人:安徽大学
申请日:2023-12-06
公开(公告)日:2024-04-05
公开(公告)号:CN117831632A
主分类号:G16B40/00
分类号:G16B40/00;G16B15/30;G06N3/0464;G06N3/048;G06N3/08
优先权:
专利状态码:在审-实质审查的生效
法律状态:2024.04.23#实质审查的生效;2024.04.05#公开
摘要:本发明公开了一种推断基因调控网络的方法,包括以下步骤:S1,构建输入数据集,包括获取数据并对数据进行预处理,最终生成训练模型输入所需的4D张量;S2,构建注意力时间卷积网络,包括空洞因果卷积、注意力残差结构、激活函数、规范化、正则化、dropout;将4D输入张量输入注意力时间卷积网络中;S3,构建基因调控网络和实现基因功能分配。本发明可同时用于构建基因调控网络和实现基因功能分配,提高了模型在推断基因对之间调控关系时的性能,此外,注意力时间卷积网络可以同时学习时程scRNA‑seq数据的时间特征信息和空间特征信息,避免侧重于其中一类信息从而导致数据信息的丢失。
主权项:1.一种推断基因调控网络的方法,其特征在于,包括以下步骤:S1,构建输入数据集,包括获取数据并对数据进行预处理,最终生成训练模型输入所需的4D张量;S2,构建注意力时间卷积网络,包括空洞因果卷积、注意力残差结构、激活函数、规范化、正则化、dropout;将4D输入张量输入注意力时间卷积网络中;S3,构建基因调控网络和实现基因功能分配。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 安徽大学 一种推断基因调控网络的方法
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