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【发明授权】胰腺导管腺癌预后检测试剂盒及其应用_中国医学科学院北京协和医院_202211478440.9 

申请/专利权人:中国医学科学院北京协和医院

申请日:2022-11-21

公开(公告)日:2024-04-05

公开(公告)号:CN116656811B

主分类号:C12Q1/6886

分类号:C12Q1/6886;C12Q1/6837;C12Q1/6827;C12N15/11

优先权:

专利状态码:有效-授权

法律状态:2024.04.05#授权;2023.09.15#实质审查的生效;2023.08.29#公开

摘要:本发明涉及一种胰腺导管腺癌预后检测试剂盒及其应用。相对于传统技术,本申请的有益效果包括:本申请人的发明人在长期临床和大量病例研究的基础上,发现了30多个基因中的一些突变水平与PDAC患者预后生存情况呈正相关:总的突变水平越高,患者预后越差。基于该发现,发明人以这些基因中的一个或者多个为目标基因,对其突变情况进行检测,所得结果能够预测PDAC根治术后患者的预后,包括预测生存期。本申请能够为胰腺癌患者的预后及后续辅助治疗提供精确的指导及临床建议提供可靠手段。

主权项:1.检测目标基因的突变位点的试剂在制备胰腺导管腺癌预后检测产品中的应用;所述目标基因为TP53BP2、EZR、PPP1R13B、TP53BP1、TP53、PPP2R1A、TMEM219、CASP10、ROBO2、ROBO1、ALCAM、HARS1、BTN2A2、EPHA1、FAM149B1、FADS1、ROCK1、MUC16、KRAS、CASP3、BID、CYCS、CASP7、CASP6、OR5H2、DCC、CCR9、DKKL1、CD1B、TP63和NEK3;或者,所述目标基因为TP53BP2、EZR、PPP1R13B、TP53BP1、TP53、PPP2R1A、TMEM219、CASP10、ROBO2、ROBO1、ALCAM、HARS1、BTN2A2、EPHA1、FAM149B1、FADS1、ROCK1、MUC16、KRAS、CASP3、BID、CYCS、CASP7、CASP6、OR5H2、DCC、CCR9、DKKL1、CD1B、TP63、NEK3和FAS基因;所述突变位点具有如下技术特征:(1)所述TP53BP2的突变位点为g.223818384AG和g.223800926CG,在基因组上对应的靶区域如SEQIDNO.1和SEQIDNO.2所示;(2)所述EZR的突变位点为g.158767615GT和g.158816837GA,在基因组上对应的靶区域如SEQIDNO.3和SEQIDNO.4所示;(3)所述PPP1R13B的突变位点为g.103736364CT和g.103754341GC,在基因组上对应的靶区域如SEQIDNO.5和SEQIDNO.6所示;(4)所述TP53BP1的突变位点为g.43420198GT和g.43479313CA,在基因组上对应的靶区域如SEQIDNO.7和SEQIDNO.8所示;(5)所述TP53的突变位点为g.7662138GA和g.7675833AC,在基因组上对应的靶区域如SEQIDNO.9和SEQIDNO.10所示;(6)所述PPP2R1A的突变位点为g.52221980CT和g.52211610CT,在基因组上对应的靶区域如SEQIDNO.11和SEQIDNO.12所示;(7)所述TMEM219的突变位点为g.29954404AG和g.29962864TC,在基因组上对应的靶区域如SEQIDNO.13和SEQIDNO.14所示;(8)所述CASP10的突变位点为g.201217488GA,在基因组上对应的靶区域如SEQIDNO.15所示;(9)所述ROBO2的突变位点为g.77622180CT,在基因组上对应的靶区域如SEQIDNO.16所示;(10)所述ROBO1的突变位点为g.78635658TC,在基因组上对应的靶区域如SEQIDNO.17所示;(11)所述ALCAM的突变位点为g.105367284GC,在基因组上对应的靶区域如SEQIDNO.18所示;(12)所述HARS1的突变位点为g.140674126GA,在基因组上对应的靶区域如SEQIDNO.19所示;(13)所述BTN2A2的突变位点为g.26386555CT,在基因组上对应的靶区域如SEQIDNO.20所示;(14)所述EPHA1的突变位点为g.143408836CT,在基因组上对应的靶区域如SEQIDNO.21所示;(15)所述FAM149B1的突变位点为g.73168589GA,在基因组上对应的靶区域如SEQIDNO.22所示;(16)所述FADS1的突变位点为g.61816391CG,在基因组上对应的靶区域如SEQIDNO.23所示;(17)所述ROCK1的突变位点为g.21029028TC,在基因组上对应的靶区域如SEQIDNO.24所示;(18)所述MUC16的突变位点为g.68861305AC,在基因组上对应的靶区域如SEQIDNO.25所示;(19)所述KRAS的突变位点为g.25239743AG,在基因组上对应的靶区域如SEQIDNO.26所示;(20)所述CASP3的突变位点为g.184629213AG,在基因组上对应的靶区域如SEQIDNO.27所示;(21)所述BID的突变位点为g.17773840CT,在基因组上对应的靶区域如SEQIDNO.28所示;(22)所述CYCS的突变位点为g.25123479GA,在基因组上对应的靶区域如SEQIDNO.29所示;(23)所述CASP7的突变位点为g.113691724CT,在基因组上对应的靶区域如SEQIDNO.30所示;(24)所述CASP6的突变位点为g.109694390CT,在基因组上对应的靶区域如SEQIDNO.31所示;(25)所述OR5H2的突变位点为g.98282776TC,在基因组上对应的靶区域如SEQIDNO.32所示;(26)所述DCC的突变位点为g.52925144GA,在基因组上对应的靶区域如SEQIDNO.33所示;(27)所述CCR9的突变位点为g.45900542CG,在基因组上对应的靶区域如SEQIDNO.34所示;(28)所述DKKL1的突变位点为g.49366028GA,在基因组上对应的靶区域如SEQIDNO.35所示;(29)所述CD1B的突变位点为g.158329206AT,在基因组上对应的靶区域如SEQIDNO.36所示;(30)所述TP63的突变位点为g.189886780GA,在基因组上对应的靶区域如SEQIDNO.37所示;(31)所述NEK3的突变位点为g.52132963GA,在基因组上对应的靶区域如SEQIDNO.38所示;(32)所述FAS基因的突变为g.89011119CT和g.89021477GA,在基因组上对应的靶区域如SEQIDNO.39和SEQIDNO.40所示。

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