申请/专利权人：黑龙江省农业科学院草业研究所

申请日：2024-01-16

公开（公告）日：2024-04-12

公开（公告）号：CN117877581A

主分类号：G16B20/30

分类号：G16B20/30

优先权：

专利状态码：在审-公开

法律状态：2024.04.12#公开

摘要：本发明公开了一种基于基因聚合数据分析的玉米作物改良方法，涉及作物改良技术领域，包括以下步骤：步骤S1、获取与玉米作物基因聚合数据，基因聚合数据包括转录组测序数据和表型数据，并对基因聚合数据进行预处理，步骤S2、将预处理后的基因聚合数据进行分组，分为标准产量最大和最小的样本组。本发明通过预处理和差异表达分析，可以准确地筛选出与玉米作物目标特性相关的差异基因聚合数据，从而能够快速识别潜在的关键基因，并且加快作物改良的进程，并且通过合并差异基因聚合数据和与目标特性相关的基因聚合数据子集，可以得到一个综合的基因表达集，从而有助于更全面地了解与目标特性相关的基因的表达模式。

主权项：1.一种基于基因聚合数据分析的玉米作物改良方法，其特征在于，包括以下步骤：步骤S1、获取与玉米作物基因聚合数据，基因聚合数据包括转录组测序数据和表型数据，并对基因聚合数据进行预处理；步骤S2、将预处理后的基因聚合数据进行分组，分为标准产量最大和最小的样本组；步骤S3、通过差异表达分析获取两个样本组之间的基因聚合数据差异，从而筛选出与玉米作物目标特性相关的差异基因聚合数据，并通过相关性分析获取与目标特性相关的基因聚合数据子集，将差异基因聚合数据和基因聚合数据子集进行合并，以获取基因表达集；步骤S4、通过基因表达集和玉米作物目标特性的标准产量数据对回归模型进行训练，并通过交叉验证调整回归模型的参数，通过调整回归模型的参数获取回归模型的最小均方误差，在回归模型达到最小均方误差时，获取回归模型的特征参数，并获取特征参数对应的基因表达集，从而获取候选基因集；步骤S5、对候选基因集进行GO注释和KEGG分析，并基于GO注释和KEGG分析对玉米作物进行改良。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 黑龙江省农业科学院草业研究所 一种基于基因聚合数据分析的玉米作物改良方法

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