申请/专利权人：中山大学肿瘤防治中心(中山大学附属肿瘤医院、中山大学肿瘤研究所)

申请日：2023-09-26

公开（公告）日：2024-04-16

公开（公告）号：CN117334325B

主分类号：G16H50/20

分类号：G16H50/20;G16H50/70;G16B30/10;G16B50/00;G16B40/20

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.04.16#授权;2024.01.19#实质审查的生效;2024.01.02#公开

摘要：本发明属于医疗诊断、治疗和预测复发技术领域，提供了一种LCAT在肝细胞癌诊断、治疗和预测复发的应用，首先提取GEO数据库中KEGG代谢相关基因数据集并进行处理，接着使用LASSO回归算法基于KEGG代谢相关基因集在GEO数据库整合数据集并构建风险评估模型，然后与接受手术的肝癌病人的术后肿瘤和周围正常组织转录组测序数据进行差异分析的结果取交集；本发明通过结合GEO公共数据库分析发现LCAT在肝癌组织中低表达，与病人的不良预后相关；并且LCAT在肝癌组织和正常组织中呈现显著差异。进一步，通过临床肝癌病人组织样本，证明可以将LCAT作为诊断、治疗和预测复发的分子标志物在临床中应用。

主权项：1.一种LCAT在肝细胞癌预测复发的应用，其特征在于：包括以下步骤：S1、首先提取GEO数据库中KEGG代谢相关基因数据集并进行处理；S2、接着使用LASSO回归算法基于KEGG代谢相关基因集在GEO数据库整合数据集并构建风险评估模型，其中构建风险评估模型应该遵循风险的概率、影响程度和可能性中的一种或多种；S3、然后与接受手术的肝癌病人的术后肿瘤和周围正常组织转录组测序数据进行差异分析的结果取交集，筛选并鉴定出LCAT作为肝癌病人术后高危复发基因；S4、然后通过公共数据库分析和小鼠皮下瘤模型发现LCAT的高表达能够激活TIME中的T细胞和NK细胞并发挥抑制肿瘤的作用，并且通过进一步探究鉴定出了TAMs作为关键的抗原递呈细胞APCs发挥了激活免疫效应细胞的作用；S5、最后结合前期研究成果选择MNK激酶家族进一步分析，并结合TCGA公共数据库分析发现MNK1在肝癌组织中高表达，得到最终结论；所述S1中具体步骤如下：S11、首先提取GEO数据库中的数据并进行整合；S12、接着将得到的数据集进行数据集划分，数据集划分应该遵循训练集、验证集和测试集的比例6:1:1。

全文数据：

权利要求：

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