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【发明授权】一种构建抗体互补决定区文库的方法_南京金斯瑞生物科技有限公司_202080085735.2 

申请/专利权人:南京金斯瑞生物科技有限公司

申请日:2020-12-13

公开(公告)日:2024-04-19

公开(公告)号:CN114929737B

主分类号:C07K16/00

分类号:C07K16/00;C07K16/22;C12N15/10;C12N15/63;C12N15/70;C40B40/10;G01N33/15;G01N33/53;A61K49/00

优先权:["20191213 CN 2019112816969"]

专利状态码:有效-授权

法律状态:2024.04.19#授权;2022.09.06#实质审查的生效;2022.08.19#公开

摘要:一种构建抗体互补决定区CDR文库的方法和装置。以及用于确定抗体CDR文库的各个成员序列出现频率的方法、装置和计算机程序产品。通过所述方法、装置和计算机程序产品能够获得一个或多个位置具有特定氨基酸分布的抗体CDR文库。

主权项:1.一种生成CDR氨基酸序列文库的方法,该方法包括下述步骤:1根据CDR氨基酸序列的各个位置容许的氨基酸残基的预定种类,以及根据指定排除的序列,确定所有容许的CDR氨基酸序列,产生备选CDR氨基酸序列集合;2根据CDR氨基酸序列文库的预定容量和CDR氨基酸序列每一个位置容许的每一种氨基酸残基的预定出现频率,确定在CDR氨基酸序列文库中CDR氨基酸序列每一个位置处每一种氨基酸残基的容许数目;并3循环进行从备选CDR氨基酸序列集合中随机挑选一种CDR氨基酸序列加入CDR氨基酸序列文库,直至加入CDR氨基酸序列文库的CDR氨基酸序列的累计数目达到CDR氨基酸序列文库的预定容量,由此生成CDR氨基酸序列文库,其中3.1当备选CDR氨基酸序列集合尚未清空时,从备选CDR氨基酸序列集合中随机挑选一种CDR氨基酸序列,其中3.1.1当将挑选的CDR氨基酸序列加入CDR氨基酸序列文库没有导致任何一个位置处对应氨基酸残基的累计数目超出该位置处该对应氨基酸残基的容许数目时,将挑选的CDR氨基酸序列加入CDR氨基酸序列文库,或者3.1.2当将挑选的CDR氨基酸序列加入CDR氨基酸序列文库导致至少一个位置处对应氨基酸残基的累计数目超过该位置处该对应氨基酸残基的容许数目时,自备选CDR氨基酸序列集合移除挑选的CDR氨基酸序列,或者3.2当备选CDR氨基酸序列集合已经清空时,从最初的备选CDR氨基酸序列集合中随机挑选一种CDR氨基酸序列,其中所述CDR氨基酸序列文库的预定容量为1,000至10,000条氨基酸序列。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 南京金斯瑞生物科技有限公司 一种构建抗体互补决定区文库的方法

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