申请/专利权人:中国水产科学研究院珠江水产研究所;广州瑞科基因科技有限公司
申请日:2024-01-03
公开(公告)日:2024-04-12
公开(公告)号:CN117877586A
主分类号:G16B30/10
分类号:G16B30/10;G16B20/20;G16B40/00
优先权:
专利状态码:在审-实质审查的生效
法律状态:2024.04.30#实质审查的生效;2024.04.12#公开
摘要:本发明属于基因检测技术领域,公开了一种适用于ZWXY性别决定系统的性别特异标记检测方法,使用全基因组高通量测序策略,结合基因组组装技术、双端测序数据精细比对技术和特征序列检测技术,识别性别特异标记;通过基因组组装,获得雌性与雄性基因组序列,并根据序列比对结果,分析雌性与雄性基因组序列间的序列特征,检测分析与鉴定性别相关联的基因组序列。本发明采用全基因组高通量测序策略实现了稳定、灵敏、特异、高效的性别标记检测分析,操作简单,突变率低,耗时短,且对平台要求较低。由本发明的测序深度与覆盖度关系可知,当测序深度在32倍时,基因组覆盖率超过90%;当测序深度在43倍时,基因组覆盖率超过95%。
主权项:1.适用于ZWXY性别决定系统的性别特异标记检测方法,其特征在于,包括:第一步,构建数学模型,通过计算机模拟获得第一轮和第二轮筛选中合适的样本数;第二步,确定使用3雌3雄的样本组合进行第一轮性别特异性标记的筛选;第三步,确定为ZW性别决定系统后,选取包含30个雄性中华鳖个体的混池进行测序和第二轮比对;第四步,PCR的初步验证,群体验证和胚胎验证,来确定性别特异性标记的准确性。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 中国水产科学研究院珠江水产研究所;广州瑞科基因科技有限公司 适用于ZW/XY性别决定系统的性别特异标记检测方法
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