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【发明公布】一种用于检测肺腺癌细胞周期进展通路相关基因突变的ncRNA及预测模型_复旦大学附属中山医院_202111020869.9 

申请/专利权人:复旦大学附属中山医院

申请日:2021-09-01

公开(公告)日:2021-10-29

公开(公告)号:CN113564259A

主分类号:C12Q1/6886(20180101)

分类号:C12Q1/6886(20180101);C12N15/113(20100101)

优先权:

专利状态码:有效-授权

法律状态:2023.09.26#授权;2021.11.16#实质审查的生效;2021.10.29#公开

摘要:本发明公开了一种用于检测肺腺癌细胞周期进展通路相关基因突变的ncRNA及预测模型。本发明通过运用RNA测序、套索算法LASSO和二分类Logistic回归获得与细胞周期通路状态高度相关的ncRNA,并构建评分score,进而通过受试者工作曲线ROC分析得到肺腺癌中score相应的截断值,可用于预测肺腺癌细胞周期通路相关基因突变。本发明的预测模型经验证在应用于检测肺腺癌细胞周期进展通路相关基因突变中具有灵敏度高,特异性强的优点,具有较好的应用前景。

主权项:1.一种用于检测肺腺癌细胞周期进展通路相关基因CDKN2ACCND1CCNE1CDK4RB1突变的ncRNA,其特征在于,包括TPTEP1,LINC00885,MIR663AHG,HOTAIR,RPSAP56,SNRPCP1,C5orf17,MIR561,THAP5P1,USP32P3,PTCHD3P2,LINC00887,LINC00565,RN7SKP106,AP000351.13,TARDBPP2,HILS1,CCT6P2,GSTA8P,HK2P1,ZEB2P1,WASIR1,ERVWE2,C7orf69,LINC01475,CEP57L1P1,LINC01551,DDX11L16,TRIM53AP,SDAD1P2,AC104131.1,LINC00485,LINC00710,CYP1D1P和ANKRD30BP2。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 复旦大学附属中山医院 一种用于检测肺腺癌细胞周期进展通路相关基因突变的ncRNA及预测模型

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