申请/专利权人：中山大学;国药集团广东环球制药有限公司

申请日：2021-07-03

公开（公告）日：2023-06-02

公开（公告）号：CN113593717B

主分类号：G16H70/40

分类号：G16H70/40;G16H20/90;G16B5/00

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2023.06.02#授权;2021.11.19#实质审查的生效;2021.11.02#公开

摘要：本发明涉及当归六黄汤治疗溃疡性结肠炎作用机制的研究方法。通过TCMSP和uniprot等数据库分析获得活性成分与疾病的交集靶点。基于String构建蛋白质‑蛋白质相互作用PPI网络，应用Cytoscape软件对结果进行可视化分析PPI网络中的重要模块和核心靶点。采用Metascape对靶点进行基因GO和KEGG通路富集分析，获得成分‑靶点‑基因功能‑通路‑疾病的可视化图形，并对作用机制解析。本方法为研究当归六黄汤治疗溃疡性结肠炎的药物‑靶点相互作用机理提供了新方法；解决了多活性成分和多靶点蛋白之间相互作用的数量太大，难筛选的难题，对于指导中药复方的研发具有重要的应用意义。

主权项：1.一种当归六黄汤治疗溃疡性结肠炎作用机制的研究方法，其特征在于，包括以下步骤：1.1筛选当归六黄汤活性成分：根据中药系统药理学分析数据库平台，以生物口服利用度≥30％、类药性指数≥0.1、Caco-2细胞渗透率≥0.4作为条件，筛选数据库中当归六黄汤全组份的活性成分；1.2筛选活性成分的作用靶点：运用TCMSP在线数据库筛选当归六黄汤活性成分的作用靶点，并将靶点数据通过UniProt数据库，进行归一化和标准化命名，最终得到当归六黄汤七味药材活性成分的潜在靶点407个；1.3筛选溃疡性结肠炎候选靶点：在疾病靶标数据库，检索筛选疾病靶点基因作为该病候选靶点，筛选当归六黄汤活性成分的潜在靶点和疾病靶点的交集基因作为当归六黄汤治疗溃疡性结肠炎的候选靶点；1.4构建当归六黄汤活性成分-疾病靶点-UC网络：将当归六黄汤活性成分的作用靶点对应当归六黄汤治疗溃疡性结肠炎的候选靶点建立D-U网络，使用Cytoscape3.7.2软件系统分析计算出连接数，根据degree值筛选出前六种成分，分别是β-谷甾醇、地黄素、汉黄芩素、豆甾醇、黄芩素和黄连碱；1.5GO功能注释和KEGG通路富集分析：通过metascape在线数据库对交集基因进行基因本体功能注释和KEGG通路富集分析，确定潜在靶点相关的生物学功能，将KEGG通路富集结果和交集靶点基因信息导入Cytoscape3.7.2软件中，构建“靶点-通路”富集网络，实现富集分析结果的可视化，提示当归六黄汤对肿瘤、炎症和免疫的调节功能与溃疡性结肠相关；1.6构建蛋白质-蛋白质相互作用PPI网络：将获得的交集靶基因上传到String数据库，选择多种蛋白质、智人和置信度0.9选项，获取交集靶点基因的蛋白质-蛋白质相互作用PPI网络数据，并利用Cytoscape3.7.2软件对结果进行可视化分析；1.7核心基因以及关键化合物筛选与评价：利用Cytoscape3.7.2软件的“cytoHubba”插件中的MCC方法确定了前10个核心基因，通过metascape数据库对核心基因进行了GO和KEGG路径分析，揭示核心基因与可能的治疗成分之间的关系；根据PPI网络发现，上述10个核心基因，包括IL6、JUN、TNF、AKT1、MYC、TP53、VEGFA、CXCL8、STAT3和HSP90AA1与疾病密切相关；在DGLHD中鉴定了与核心基因对应的当归六黄汤活性成分主要包括β-谷甾醇、地黄素、汉黄芩素、豆甾醇、黄芩素和黄连碱，黄芩的汉黄芩素可针对大部分核心基因，为关键活性成分。

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