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【发明授权】单倍型祖源数据库的使用方法_广州鸿溪见杉科技有限公司_202210564506.X 

申请/专利权人:广州鸿溪见杉科技有限公司

申请日:2022-05-23

公开(公告)日:2023-07-14

公开(公告)号:CN114783528B

主分类号:G16B50/00

分类号:G16B50/00;G16B20/30;G16B20/20

优先权:

专利状态码:有效-授权

法律状态:2023.07.14#授权;2022.08.09#实质审查的生效;2022.07.22#公开

摘要:本发明公开了单倍型祖源数据库的使用方法,步骤包括:识别框移动识别落入识别框内的n个连续SNP位点信息;将识别框内的n个连续SNP位点的信息与比对单位匹配,若不能匹配到SNP位点的信息相同的比对单位,为未知;若能匹配到SNP位点的信息相同的比对单位,则将其记录对应的人种信息,调取能识别n+1个连续SNP位点的识别框,将包含与比对单位相同的n个SNP位点的n+1个连续的SNP位点进行识别;重复上一步骤直到识别框内的若干个连续SNP位点信息不能匹配到SNP位点信息相同的比对单位。本发明的优点有:祖先溯源速度快、误差小、清晰度高、大数据容量大,为找出疾病与基因关联、精准医疗、分子检测、用药指导等医药领域技术研究提供基础。

主权项:1.单倍型祖源数据库的使用方法,其特征在于:步骤包括:1对数据库中各人种的样本单倍型SNP信息进行提取,得到大量不同的含有若干个连续的SNP位点信息的比对单位,把所有比对单位标记其对应的所有人种信息;2设置识别n个连续SNP的识别框,所述识别框在待测单倍型上移动并识别落入识别框内的n个连续SNP位点信息;3将识别框内的n个连续SNP位点信息与比对单位匹配,若不能匹配到SNP位点信息相同的比对单位,则将其记录为未知;若能匹配到SNP位点信息相同的比对单位,则将其记录对应的人种信息,该识别框继续移动识别,同时调取能识别n+1个连续SNP位点的识别框,将包含与比对单位相同的n个SNP位点的n+1个连续的SNP位点进行识别;4重复上一步骤直到识别框内的若干个连续SNP位点信息不能匹配到SNP位点信息相同的比对单位,将其记录为未知,以此完成查找待测单倍型祖源的工作。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 广州鸿溪见杉科技有限公司 单倍型祖源数据库的使用方法

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