申请/专利权人：复旦大学附属中山医院

申请日：2021-09-01

公开（公告）日：2023-09-26

公开（公告）号：CN113564259B

主分类号：C12Q1/6886

分类号：C12Q1/6886;C12N15/113

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2023.09.26#授权;2021.11.16#实质审查的生效;2021.10.29#公开

摘要：本发明公开了一种用于检测肺腺癌细胞周期进展通路相关基因突变的ncRNA及预测模型。本发明通过运用RNA测序、套索算法LASSO和二分类Logistic回归获得与细胞周期通路状态高度相关的ncRNA，并构建评分score，进而通过受试者工作曲线ROC分析得到肺腺癌中score相应的截断值，可用于预测肺腺癌细胞周期通路相关基因突变。本发明的预测模型经验证在应用于检测肺腺癌细胞周期进展通路相关基因突变中具有灵敏度高，特异性强的优点，具有较好的应用前景。

主权项：1.一种检测试剂在制备用于检测肺腺癌细胞周期进展通路相关基因CDKN2ACCND1CCNE1CDK4RB1突变的试剂盒中的应用，其特征在于，所述检测试剂由检测以下基因表达量的试剂组成：TPTEP1,LINC00885,MIR663AHG,HOTAIR,RPSAP56,SNRPCP1,C5orf17,MIR561,THAP5P1,USP32P3,PTCHD3P2,LINC00887,LINC00565,RN7SKP106,AP000351.13,TARDBPP2,HILS1,CCT6P2,GSTA8P,HK2P1,ZEB2P1,WASIR1,ERVWE2,C7orf69,LINC01475,CEP57L1P1,LINC01551,DDX11L16,TRIM53AP,SDAD1P2,AC104131.1,LINC00485,LINC00710,CYP1D1P和ANKRD30BP2；所述试剂盒中还包括说明书，所述说明书中记载了如下所示的预测模型：score＝-1.4038×TPTEP1+0.7367×LINC00885+-0.9344×MIR663AHG+-1.3793×HOTAIR+-2.8758×RPSAP56+-1.3070×SNRPCP1+-1.1742×C5orf17+-2.2295×MIR561+1.8387×THAP5P1+2.3643×USP32P3+1.9552×PTCHD3P2+0.7483×LINC00887+2.1776×LINC00565+-7.7255×RN7SKP106+0.7392×AP000351.13+2.9645×TARDBPP2+2.4933×HILS1+3.9862×CCT6P2+0.9868×GSTA8P+6.1270×HK2P1+8.6499×ZEB2P1+1.9156×WASIR1+0.9007×ERVWE2+3.1400×C7orf69+1.5498×LINC01475+2.3895×CEP57L1P1+3.2961×LINC01551+1.0197×DDX11L16+3.1975×TRIM53AP+3.1147×SDAD1P2+-2.1999×AC104131.1+2.7171×LINC00485+17.3023×LINC00710+6.9753×CYP1D1P+25.6417×ANKRD30BP2-4.2039，所述预测模型中各基因的表达量代表的是基因相对表达量；所述预测模型的评分score截断值为-5.791。

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