申请/专利权人：宁夏医科大学

申请日：2023-07-03

公开（公告）日：2023-10-13

公开（公告）号：CN116884640A

主分类号：G16H70/40

分类号：G16H70/40

优先权：

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2023.10.31#实质审查的生效;2023.10.13#公开

摘要：本发明公开了基于网络药理学的复方杞蓉片治疗疾病的分析方法，采用网络药理学方法以探讨复方杞蓉片治疗早发性卵巢功能不全的作用机制，通过进入TCMSP数据库获取复方杞蓉片的有效成分及相应靶点，通过查询Genecards等数据库，获取疾病相关的靶点，并利用Venn图与药物作用靶点取交集，筛选复方杞蓉片治疗早发性卵巢功能不全的关键靶点，利用STRING平台建立预测靶蛋白之间的相互关系网络，根据联系密切程度筛选出核心靶标，用R语言进行核心靶标的GO生物过程分析和KEGG通路富集分析，复方杞蓉片通过多种成分、多核心靶点参与了一系列通路，通过发挥多种生物、分子过程来治疗早发性卵巢功能不全。

主权项：1.基于网络药理学的复方杞蓉片治疗疾病的分析方法，其特征在于，具体包括以下步骤：S1：复方杞蓉片活性成分及靶点的获取：首先对杞蓉片中的9味中药活性成分及作用靶点进行检索，登录中药药理学数据库TCMSPhttp:tcmspw.com，检索关键词:“锁阳”、“肉苁蓉”、“淫羊蕾”、“菟丝子”、“枸杞子”、“金樱子”、“女贞子”、“北五味子”和“蛇床子”，将口服生物利用度OB值设置为≥30%、类药性DL值设定为≥0.18，以此来筛选出符合条件的中药活性成分，得到复方杞蓉片活性成分的ID和靶基因名称数据，对于未能从TCMSP检索出的药物并通过中国知网和维普平台查阅文献检索其所有活性成分，然后通过TCMSP查阅相关活性成分所对应的“MolID”及其靶点基因信息，对于未能检索出“MolID”的活性成分，通过通过Pubchem数据库确定所有筛选出来分子的三维结构，然后将CanonicalSmile号输入小分子药物靶点预测在线平台获得上述药物的全部潜在靶点基因，运用Uniprot数据库http:www.uniprot.org及Perlhttp:www.perl.orgger.html语言脚本进行蛋白基因的转换，剔除非人源基因，删除无效重复靶点，得到标准化的基因名；S2：POI疾病靶点的获取：使用关键词“Prematureovarianinsufficiency”在GeneCards（https:www.genecards.org）、OMIM（https:omim.org）、DrugBank（https:go.drugbank.com）数据库中进行检索，从而得到与POI相关靶点，将五个数据库所有靶点整合在excle中，剔除重复基因，并经Uniprot数据库进行校正，得到疾病靶点基因信息；S3：靶蛋白相互作用网络构建：登录Venn2.1.0网站，在LIST1与LIST2中分别输入药物与疾病的靶点，平台自动生成药物与疾病的靶点，绘制出维恩图Venn图，将获得的复方杞蓉片与POI的共同靶点进行转换后登录String平台https:string-db.org，选择“homosapiens”，构建蛋白质互作用网络PPI图；S4：GO分析和KEGG通路富集分析：通过Bioconductorhttp:www.bio-conductor.org数据库进行GO分析和KEGG通路富集分析，使用Cytoscape软件，构建出“药物-活性成分-靶点”网络并分析其核心靶点，利用DAVID6.8GO基因功能从生物过程（BiologicalProcess，BP）、细胞成分（CellularComponent，CC）、分子功能（MolecularFunction，MF）三方面描述复方杞蓉片治疗POI的作用靶蛋白在基因功能中的作用，选取GO功能条目前10条，KEGG通路条目与早发性卵巢功能不全有关的20条通路（P＜0.01）作为复方杞蓉片治疗POI的主要基因功能富集过程和信号通路，预测复方杞蓉片治疗POI的作用机制。

全文数据：

权利要求：

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