申请/专利权人:中国农业科学院深圳农业基因组研究所;中国农业科学院农业基因组研究所
申请日:2021-09-30
公开(公告)日:2024-01-30
公开(公告)号:CN113736906B
主分类号:C12Q1/6895
分类号:C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11
优先权:
专利状态码:有效-授权
法律状态:2024.01.30#授权;2021.12.21#实质审查的生效;2021.12.03#公开
摘要:本发明涉及植物生物技术领域,具体涉及一种用于检测番茄黄萎病抗性的SNP位点组合及其应用。基于此,本发明开发了一种能够快速、直观且有效鉴定目标SNP位点基因型状态的引物组合、试剂盒以及检测方法。应用本发明可实现对番茄黄萎病抗性基因Ve1和Ve2区段单倍型的快速、精准和高通量检测,具有操作简单、成本低廉、可自动化、通量效率高、标记稳定、安全无毒无害等优点,可以在番茄苗期快速、准确和高通量的进行番茄黄萎病抗性鉴定,降低人工接种鉴定和田间移栽工作量,提高育种效率、降低育种成本、加速育种进程,非常适合现代商业化育种应用及大规模遗传改良研究。
主权项:1.一种检测SNP位点组合的试剂在检测番茄黄萎病抗性中的应用,其特征在于,所述SNP位点组合包括位于番茄黄萎病抗性基因Ve1内部及两侧的第一SNP位点组合和位于番茄黄萎病抗性基因Ve2内部及两侧的第二SNP位点组合,所述第一SNP位点组合包括所述Ve1-SNP02位点、所述Ve1-SNP03位点以及所述Ve1-SNP04位点中的一个或者多个,所述第二SNP位点组合包括所述Ve2-SNP03位点以及所述Ve2-SNP04位点中的一个或者多个: 编号 基因 染色体 SNP物理位置 等位基因 Ve1-SNP02 Ve1 Chr09 56183 T或A Ve1-SNP03 Ve1 Chr09 55723 G或C Ve1-SNP04 Ve1 Chr09 54848 G或A Ve2-SNP03 Ve2 Chr09 49172 G或A Ve2-SNP04 Ve2 Chr09 48822 C或A 表中,基因序列及SNP物理位置信息对应于番茄Heinz1706参考基因组SL2.50版本。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 中国农业科学院深圳农业基因组研究所;中国农业科学院农业基因组研究所 用于检测番茄黄萎病抗性的SNP位点组合及其应用
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