申请/专利权人：安酷生物技术(苏州)有限公司

申请日：2023-07-12

公开（公告）日：2024-02-13

公开（公告）号：CN116741262B

主分类号：G16B15/30

分类号：G16B15/30;G16H20/10;G16H70/40

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.02.13#授权;2023.09.29#实质审查的生效;2023.09.12#公开

摘要：本发明属于人工智能技术领域，提供了一种AI辅助筛选药食同源中药ALK抑制剂的方法，所述方法包括以下步骤：1查询与搜集药食同源中药后，建立药食同源中药数据库；2以药食同源中药数据库中的中药名称进行检索、筛选活性单体成分，以构建药食同源中药的活性单体成分数据集；3分子对接分析，筛选具有ALK蛋白亲和力的活性单体；4建立具有ALK蛋白亲和力的活性单体与中药的映射关系，筛选得到潜在的药食同源中药ALK抑制剂；5在细胞水平上，验证所述药食同源中药ALK抑制剂的抑制活性。所述方法可快速筛选低毒、ALK蛋白抑制活性的中药。

主权项：1.一种AI辅助筛选药食同源中药ALK抑制剂的方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：1查询与搜集药食同源中药后，建立药食同源中药数据库；2以药食同源中药数据库中的中药名称进行检索、筛选活性单体成分，以构建药食同源中药的活性单体成分数据集；3分子对接分析，筛选具有ALK蛋白亲和力的活性单体；4建立具有ALK蛋白亲和力的活性单体与中药的映射关系，筛选得到潜在的药食同源中药ALK抑制剂；5在细胞水平上，验证所述药食同源中药ALK抑制剂的抑制活性；所述步骤2包括以下步骤：Ⅰ在中草药数据库SymMap进行检索，下载、整理数据库中收录的中药及单体成分信息；Ⅱ将中药及单体成分信息根据PubChemID，TCMIDID，TCMSPID进行分类，并将其分别映射至PubChem、TCMSP和TCMID数据库；Ⅲ去除不同中药中重复出现的活性单体，从而得到药食同源中药的活性单体成分数据集；步骤3中所述分子对接分析包括以下步骤：ⅰ以ALK蛋白-克唑替尼的复合物结构为基础，构建受体蛋白构象；ⅱ生成活性单体的三级结构信息，构建配体分子构象，利用软件将活性单体成分数据集中的SDF文件转换为具有三级结构信息的pdbqt文件；ⅲ进行分子对接的蛋白口袋设置；ⅳ将受体蛋白构象与配体分子构象进行分子对接验证；所述步骤Ⅱ还包括以下步骤：对于映射失败的药食同源中药，以中药名为关键词在网络或数据库进行检索，筛选出其活性单体；对于最终映射到PubChem数据库的活性单体，下载其“SDF文件”；对于最终映射到TCMSP数据库的活性单体，下载其“mol2文件”，并将其“mol2文件”转换为“SDF文件”；对于只映射至TCMID数据库的活性单体，舍弃其成分信息。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 安酷生物技术(苏州)有限公司 一种AI辅助筛选药食同源ALK抑制剂的方法

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