申请/专利权人：河南农业大学

申请日：2023-09-20

公开（公告）日：2024-02-27

公开（公告）号：CN117604115A

主分类号：C12Q1/6888

分类号：C12Q1/6888;C12Q1/6874;C12Q1/6869;G16B20/20

优先权：

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2024.03.26#实质审查的生效;2024.02.27#公开

摘要：本发明涉及一种地方鸡40K全基因组SNP液相芯片及其应用。本发明通过全基因组重测序技术获得中国地方鸡58个品种的955个个体的全基因组遗传信息，通过严格筛选获得45669个SNP分子标记，其中40595个源于鸡参考基因组，其余5074个源于鸡泛序列。以获得的SNP分子标记为检测靶点的地方鸡40K全基因组液相芯片，可以通过靶向捕获高通量测序技术进行基因分型，经检测分型检出率达99.6％，且一致性良好。随机品种SNP分型验证说明，本发明的液相芯片分型与基因组重测序相比，主成分分析结果一致性极高。本发明的液相芯片为中国地方鸡遗传资源鉴定、遗传资源保护提供了重要的技术支撑。

主权项：1.一种地方鸡40K全基因组SNP液相芯片，其特征在于：所述地方鸡40K全基因组SNP液相芯片的检测靶点由SNP分子标记组合1和SNP分子标记组合2组成；所述组合1由鸡参考基因组GRCg6a，GCF_000002315.6的40595个SNP分子标记组成；所述组合2由鸡泛序列的5074个SNP分子标记组成；所述SNP分子标记在鸡参考基因组GRCg6a，GCF_000002315.6或鸡泛序列上的位置如下表1所示：表1

全文数据：

权利要求：

百度查询： 河南农业大学 一种地方鸡40K全基因组SNP液相芯片及其应用

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