申请/专利权人：中国人民解放军陆军军医大学第二附属医院

申请日：2023-11-28

公开（公告）日：2024-03-01

公开（公告）号：CN117637036A

主分类号：G16B50/00

分类号：G16B50/00;G06F16/901;G16B25/10

优先权：

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2024.03.19#实质审查的生效;2024.03.01#公开

摘要：本发明涉及一种基于本体数据库特定节点的最近共同祖先追溯方法，属于生物信息领域。该方法包括以下步骤：S1：从富集到的条目当中抽取对应的GOID，再将GOID回执给对应接口获得GO有向无环图关系数据；S2：将GO有向无环图关系数据构建成树，并将该树的父节点指向子节点关系进行反向；S3：找到两个节点的最近共同祖先；S4：处理多个点的情况；S5：利用改进的LCA算法，通过输入的特定节点对最近共同祖先节点进行追溯，应用到数据可视化上对最近共同祖先节点进行标识，以对特定节点功能进行归属。本发明可为GO各个子节点的基因功能注释进行归类或者定性，在拥有成千上万个节点的有向无环图上，对其多个特定节点向上追溯。

主权项：1.基于本体数据库特定节点的最近共同祖先追溯方法，其特征在于：该方法包括以下步骤：S1：在Enrichr在线平台或GO数据库中进行基因功能富集，从富集到的条目当中抽取对应的GOID，再将GOID回执给对应接口获得GO有向无环图关系数据；S2：将GO有向无环图关系数据构建成树，并将该树的父节点指向子节点关系进行反向；S3：找到两个节点的最近共同祖先，即从两个节点开始，沿着它们的父节点向上遍历，直到找到一个最近共同祖先；S4：处理多个点的情况，即先找到所有点的最近共同祖先，然后返回这个祖先；S5：利用改进的LCA算法，通过输入的特定节点对最近共同祖先节点进行追溯，应用到数据可视化上对最近共同祖先节点进行标识，以对特定节点功能进行归属。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 中国人民解放军陆军军医大学第二附属医院 基于本体数据库特定节点的最近共同祖先追溯方法

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