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【发明公布】用于评估受试者罹患肝细胞肝癌可能性的模型的构建方法_复旦大学附属中山医院;骏实生物科技(上海)有限公司_202311678114.7 

申请/专利权人:复旦大学附属中山医院;骏实生物科技(上海)有限公司

申请日:2023-12-07

公开(公告)日:2024-03-08

公开(公告)号:CN117672521A

主分类号:G16H50/30

分类号:G16H50/30;G16H50/70;G06F18/214

优先权:

专利状态码:在审-实质审查的生效

法律状态:2024.03.26#实质审查的生效;2024.03.08#公开

摘要:本申请提供了一种用于评估受试者罹患肝细胞肝癌可能性的模型的构建方法、系统、试剂盒以及应用该构建方法的电子设备和存储有计算机程序代码的计算机可读介质。该构建方法包括获取多个自变量,对多个自变量进行筛选和数据处理,并在回归模型训练过程中进一步筛选有效自变量,减少自变量的数量,同时通过相关性分析获得自变量之间的关系,采用具有替换关系的自变量进行替换和组合,得到多个预测模型。本申请的预测模型使用较少的有效自变量就可以获得较好的预测结果,预测效率高、适用范围广、成本低。

主权项:1.一种用于评估受试者罹患肝细胞肝癌可能性的模型的构建方法,其特征在于,包括:步骤S10:获取用于模型的多个自变量,所述多个自变量包括:microRNA在血浆中的表达量hsa-miR-122、hsa-miR-192、hsa-miR-21、hsa-miR-223、hsa-miR-26a、hsa-miR-27a、hsa-miR-801,以及受试者的年龄Age、性别Gender、肿瘤标志物检测结果、血液学指标检测结果中的任意个,所述肿瘤标志物检测结果包括甲胎蛋白AFP,所述血液学指标检测结果包括血小板计数PLT、总胆红素TB、血清谷草转氨酶GGT、凝血酶原时间PT、国际标准化比值INR、天门冬氨酸氨基转换酶AST、丙氨酸氨基转移酶ALT中的任意个,并对所述多个自变量进行结构化处理;步骤S20:将所述受试者分为肝细胞肝癌组和非肝细胞肝癌组,并分别编码为1和0,形成用于模型的因变量;步骤S30:对所述多个自变量进行筛选获得有效自变量;步骤S40:对所述多个自变量进行相关性分析,确定所述多个自变量之间的关系;步骤S50:比较每个所述自变量在进行Log10转换前后与因变量间的相关系数,确定是否对所述自变量进行Log10转换;步骤S60:将数据划分为训练集和测试集,根据所述训练集构建包含所述自变量的回归模型,根据所述测试集对所述回归模型的性能进行测试,其中,所述数据包括所述多个自变量和所述因变量;步骤S70:根据回归分析结果中的每个所述自变量的p-value、相关系数和所述回归模型在训练集和测试集上的AUC值中的任意个对所述有效自变量进行进一步筛选,获得筛选后的有效自变量,其中,当自变量的p-value小于0.05时,将该自变量的相关系数大于第一阈值的自变量作为有效自变量;步骤S80:重复执行所述步骤S70,直到所述回归模型在所述训练集上的AUC值降低至0.8附近,所述筛选后的有效自变量的数量大于等于2,并且所述筛选后的有效自变量中至少包括一个microRNA,获得若干第一模型;步骤S90:根据所述步骤S40获得的所述多个自变量之间的关系,对所述若干第一模型中具有替换关系的自变量进行替换和组合,采用替换和组合后的自变量构建回归模型,获得若干第二模型,所述模型包括所述第一模型和所述第二模型中的任意个。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 复旦大学附属中山医院;骏实生物科技(上海)有限公司 用于评估受试者罹患肝细胞肝癌可能性的模型的构建方法

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