申请/专利权人:北京源生康泰基因科技有限公司
申请日:2023-12-12
公开(公告)日:2024-03-15
公开(公告)号:CN117701678A
主分类号:C12Q1/6806
分类号:C12Q1/6806
优先权:
专利状态码:在审-实质审查的生效
法律状态:2024.04.02#实质审查的生效;2024.03.15#公开
摘要:本发明涉及微生物基因检测技术领域,具体涉及一种用于高效去除感染样本宿主核酸的方法,特别适用于肺泡灌洗液、痰液、脑脊液等感染样本的病原体宏基因组检测和宏转录组检测。通过RIPA裂解液将宿主和微生物差异裂解,并使用全能核酸酶去除宿主核酸,大大降低宿主基因组占比,包括步骤:对采集样本进行富集;裂解宿主细胞;消化宿主核酸;富集微生物细胞;裂解微生物,回收微生物核酸。本发明可同时消化宿主DNA和RNA,使其同时适用于宏基因组测序和宏转录组测序。该方法可在60min内完成宿主核酸的去除及回收微生物核酸全过程,可去除感染样本中2%‑95%的宿主核酸,大幅提高感染样本中病原微生物核酸比例,具有高效、简易、低成本和快速去宿主核酸的特点。
主权项:1.一种用于高效去除感染样本宿主核酸的方法,其特征在于,包括以下步骤:S1,对采集样本进行富集:采用高速离心对样本进行离心,离心所得沉淀作为富集后的样本;S2,对所述富集后的样本进行宿主细胞裂解:取富集后的样本加入蛋白裂解液得到第一反应液;S3,宿主核酸消化:配置缓冲液,混合第一反应液和缓冲液孵育,得到第二反应液;S4,对样本微生物富集:采用高速离心富集微生物菌体;S5,对富集微生物裂解,回收微生物核酸:通过高速研磨破碎,释放微生物核酸,再使用商业化磁珠法核酸回收试剂进行微生物核酸回收。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 北京源生康泰基因科技有限公司 一种用于高效去除感染样本宿主核酸的方法
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