申请/专利权人:中国科学院生态环境研究中心
申请日:2024-01-19
公开(公告)日:2024-04-16
公开(公告)号:CN117887867A
主分类号:C12Q1/689
分类号:C12Q1/689;C12Q1/6848;C12N15/11
优先权:
专利状态码:在审-公开
法律状态:2024.04.16#公开
摘要:本发明公开了一种精确识别鉴定耐药基因环境宿主菌的方法,包括采用改进的巢式PCR进行epicPCR,将细菌16SrRNA基因的片段与目标耐药基因相连接。本发明方法克服了现有的epicPCR的缺陷,实现了更高精度的宿主菌物种注释,对现有的epicPCR方法中的巢式PCR的引物及反应条件进行改进,将16SrRNA基因的V4‑V8或V4‑V9区与目标耐药基因相连接。相比于现有的epicPCR中扩增片段仅覆盖V4区,改进epicPCR扩增片段覆盖16SrRNA基因的V4‑V8或V4‑V9区,大幅提升epicPCR在种水平的注释率。
主权项:1.一种精确识别鉴定耐药基因环境宿主菌的方法,其特征是,包括采用改进的巢式PCR进行epicPCR扩增,将细菌16SrRNA基因的V4-V8或V4-V9区与目标耐药基因相连接。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 中国科学院生态环境研究中心 一种精确识别鉴定耐药基因环境宿主菌的方法
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