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【发明公布】用于确定核苷酸碱基检出和碱基检出质量的信噪比度量_因美纳有限公司_202280043937.X 

申请/专利权人:因美纳有限公司

申请日:2022-06-02

公开(公告)日:2024-03-19

公开(公告)号:CN117730372A

主分类号:G16B40/10

分类号:G16B40/10;G06V30/00;C12Q1/6869

优先权:["20210629 US 63/216401"]

专利状态码:在审-实质审查的生效

法律状态:2024.04.05#实质审查的生效;2024.03.19#公开

摘要:本公开描述了方法、非暂态计算机可读介质和系统,这些方法、非暂态计算机可读介质和系统可以生成带标签核苷酸碱基被添加到的寡核苷酸簇的信噪比度量,并且利用这些信噪比度量来生成核苷酸碱基检出并且确定碱基检出质量。例如,所公开的系统可以使用与从这些寡核苷酸簇检测到的光信号相关联的缩放因子和噪声水平来生成这些信噪比度量。所公开的系统可以利用这些信噪比度量根据一个或多个碱基检出分布模型生成用于生成这些信号的核苷酸碱基检出的强度值边界。附加地,所公开的系统可以利用阈值来滤除从具有低信噪比度量的寡核苷酸簇检测到的信号。所公开的系统可以进一步利用这些信噪比度量来生成所生成的核苷酸碱基检出的质量度量。

主权项:1.一种系统,所述系统包括:至少一个处理器;和包括指令的非暂态计算机可读介质,所述指令当由所述至少一个处理器执行时使得所述系统:检测来自核苷酸样品载玻片的部分内的标记的核苷酸碱基的信号;针对所述核苷酸样品载玻片的所述部分,基于所述信号的强度值,确定对应于所述信号的缩放因子和噪声水平;基于所述缩放因子和所述噪声水平生成所述核苷酸样品载玻片的所述部分的信噪比度量;以及利用碱基检出质量模型,基于所述信噪比度量生成估计对应于所述信号的核苷酸碱基检出的误差的质量度量。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 因美纳有限公司 用于确定核苷酸碱基检出和碱基检出质量的信噪比度量

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