申请/专利权人：中国医学科学院肿瘤医院

申请日：2022-11-28

公开（公告）日：2024-03-22

公开（公告）号：CN117747097A

主分类号：G16H50/30

分类号：G16H50/30;G16H50/20;G16B20/30;G06N20/00;G06F18/23;G06F18/241;G06F18/214

优先权：

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2024.04.09#实质审查的生效;2024.03.22#公开

摘要：本申请公开了一种计算机实现的方法，其通过对来自接受免疫检查点的阻断治疗如PD‑1治疗的食管癌患者的初始样本集进行多组学数据的聚类分析并用训练集和验证集对随机森林模型进行训练，得到的分类器模型可用于在临床实践中识别食管癌患者的抗PD‑1疗法的应答者获益者。本申请还公开了用于实施所述方法以进行食管癌预测免疫治疗评效的计算机系统，以及训练分类器的方法。

主权项：1.一种计算机实现的方法，包括：对来自接受过免疫检查点的阻断治疗的食管癌患者的初始样本集进行多组学数据的聚类分析，例如层次聚类分析，进行初始特征选择和样本集过滤，得到初始特征和保留样本集；对保留样本集进行过采样得到最终样本集，将最终样本集分为训练集和验证集，并使用训练集和验证集对随机森林模型进行训练，采用迭代更新进行分类特征选择和分类模型构建，直到特征数目收敛，在所述迭代过程中得到的特征集中，选择在验证集上具有最低袋外误差和最优受试者操作特征曲线下面积AUROC的特征集作为最终特征集并构建经训练的机器学习分类器；向所述经训练的机器学习分类器输入非训练受试者的多组学数据，使用经训练的机器学习分类器，生成非训练受试者对食管癌的免疫检查点的阻断治疗的反应性分类，其中所述反应性分类预测非训练受试者对所述治疗的反应性；以及使用图形化用户界面，报告非训练受试者对食管癌的免疫检查点的阻断治疗的反应性分类，其中所述多组学数据包括表达谱RNA测序、表观组学甲基化测序和基因组学外显子测序数据，优选地，所述免疫检查点的阻断治疗为抗PD-1抗体或抗PD-L1抗体治疗。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 中国医学科学院肿瘤医院 依据多组学数据建立的食管癌预测免疫治疗评效系统

免责声明
1、本报告根据公开、合法渠道获得相关数据和信息，力求客观、公正，但并不保证数据的最终完整性和准确性。
2、报告中的分析和结论仅反映本公司于发布本报告当日的职业理解，仅供参考使用，不能作为本公司承担任何法律责任的依据或者凭证。

阅读全文 双屏查看 官方信息 专利公告 收藏专利 下载PDF 下载WORD