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【发明公布】一种对肿瘤RNA测序数据的病毒检测方法及系统_厦门大学_202311803449.7 

申请/专利权人:厦门大学

申请日:2023-12-26

公开(公告)日:2024-03-22

公开(公告)号:CN117746985A

主分类号:G16B30/00

分类号:G16B30/00;G16B40/00

优先权:

专利状态码:在审-实质审查的生效

法律状态:2024.04.09#实质审查的生效;2024.03.22#公开

摘要:公开了一种对肿瘤RNA测序数据的病毒检测方法及系统,包括对原始肿瘤RNA测序数据进行预处理;处理后的肿瘤RNA测序数据输入基于序列信息的通道和基于密码子的通道进行特征提取,生成特征矩阵;构建序列信息预测模型和密码子信息预测模型,将所述基于序列信息的通道和基于密码子的通道生成的特征矩阵分别输入序列信息预测模型和密码子信息预测模型进行训练和优化;对每个测序读数的病毒概率进行预测,得到模型分数;根据模型分数选择病毒测序读数组装病毒contigs。本发明通过引入多模态深度学习方法,提高了病毒监测的精度和鲁棒性,同时能够自适应处理不同来源和不同长度的测序数据,从而更好地满足医疗和研究领域对于肿瘤测序数据中病毒鉴定的需求。

主权项:1.一种对肿瘤RNA测序数据的病毒检测方法,其特征在于,包括以下步骤:S1、对原始肿瘤RNA测序数据进行预处理;S2、处理后的肿瘤RNA测序数据输入基于序列信息的通道和基于密码子的通道进行特征提取,生成特征矩阵;S3、构建序列信息预测模型和密码子信息预测模型,将所述基于序列信息的通道和基于密码子的通道生成的特征矩阵分别输入序列信息预测模型和密码子信息预测模型进行训练和优化;S4、对每个测序读数的病毒概率进行预测,得到模型分数;S5、根据模型分数选择病毒测序读数组装病毒contigs。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 厦门大学 一种对肿瘤RNA测序数据的病毒检测方法及系统

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