申请/专利权人:西安交通大学
申请日:2023-12-22
公开(公告)日:2024-03-22
公开(公告)号:CN117737199A
主分类号:C12Q1/6806
分类号:C12Q1/6806;C12Q1/6869;C40B50/06
优先权:
专利状态码:在审-实质审查的生效
法律状态:2024.04.09#实质审查的生效;2024.03.22#公开
摘要:本发明公开了一种基于高通量测序的鉴定碱基特异性调控元件的建库方法,包括:构建候选易感SNP质粒文库;对所述候选易感SNP质粒文库进行PCR扩增、纯化后构建输入型DNA测序文库;转染质粒文库至靶细胞,获得RNA表达文库;进行反转录、纯化、PCR扩增,构建输出型DNA测序文库;对输入型DNA测序文库和输出型DNA测序文库分别添加一步法PCR扩增为不同重复组引入不同的Barcode标签序列,并分别进行末端加A尾及测序接头连接,构建混合样本测序库。该方法是一种高效低廉的基于高通量测序的建库方法,用以鉴定基因组上具有碱基特异性调控活性的功能元件。
主权项:1.一种基于高通量测序的鉴定碱基特异性调控元件的建库方法,其特征在于,包括:构建候选易感SNP质粒文库;对所述候选易感SNP质粒文库进行PCR扩增、纯化后构建输入型DNA测序文库;转染质粒文库至靶细胞,获得RNA表达文库;进行反转录、纯化、PCR扩增,构建输出型DNA测序文库;对输入型DNA测序文库和输出型DNA测序文库分别添加一步法PCR扩增为不同重复组引入不同的Barcode标签序列,并分别进行末端加A尾及测序接头连接,构建混合样本测序库。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 西安交通大学 基于高通量测序的鉴定碱基特异性调控元件的建库方法
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