申请/专利权人：广州达安基因股份有限公司

申请日：2022-10-13

公开（公告）日：2024-04-16

公开（公告）号：CN117894367A

主分类号：G16B20/30

分类号：G16B20/30;G16B50/00

优先权：

专利状态码：在审-公开

法律状态：2024.04.16#公开

摘要：本申请实施例属于生物信息技术领域，涉及一种微生物特异性序列保守性的筛选评估方法，包括获取所有目标物种的基因组序列，按照筛选规则从基因组序列中筛选出参考序列；为参考序列添加相应的分类标识，并根据参考序列构建物种序列数据库；对参考序列进行序列分类，得到序列的分类结果；记录分类结果中比对上非目标物种的物种坐标，并对物种坐标进行过滤和延伸，得到非目标物种序列坐标；使用序列操作工具，根据非目标物种序列坐标对参考序列进行序列提取，得到带有物种标签的特异性序列集合；对特异性序列集合中的特异性序列进行保守性评估。本申请可以供后续物种特异性扩增使用，提高特异性扩增的灵敏度和准确性，同时，实现微生物鉴定的目的。

主权项：1.一种微生物特异性序列保守性的筛选评估方法，其特征在于，包括下述步骤：获取所有目标物种的基因组序列，按照筛选规则从所述基因组序列中筛选出参考序列；为所述参考序列添加相应的分类标识，并根据所述参考序列和相应的所述分类标识构建物种序列数据库，确定所述物种序列数据库的序列长度为第一预设长度；将所述参考序列输入序列分类器，按照所述第一预设长度对所述参考序列进行序列分类，得到序列的分类结果；记录所述分类结果中比对上非目标物种的物种坐标，并对所述物种坐标进行过滤和延伸，得到非目标物种序列坐标；使用序列操作工具，根据所述非目标物种序列坐标对所述参考序列进行序列提取，得到带有物种标签的特异性序列集合；对所述特异性序列集合中的特异性序列进行保守性评估，得到保守值。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 广州达安基因股份有限公司 微生物特异性序列保守性的筛选评估方法

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