申请/专利权人：瑞因迈拓科技(广州)有限公司

申请日：2023-10-10

公开（公告）日：2024-03-22

公开（公告）号：CN117051129B

主分类号：C12Q1/6888

分类号：C12Q1/6888;C12Q1/689;C12Q1/70;C12Q1/6869;G16B40/00;C12R1/32;C12R1/93

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.03.22#授权;2023.12.01#实质审查的生效;2023.11.14#公开

摘要：本申请提供了一种微生物检测背景菌阈值设定方法及其应用，所述方法包括：S1.检测分组；S2.阴性测试：利用样本按照S1的检测分组分别进行测试；S3.阳性测试：在样本中添加已知微生物，按照S1的检测分组再次分别进行测试；S4.极值计算：在S2和S3的测试结果中除去S2中添加的微生物的测试数据，其他微生物测试数据均一化之后计算在微生物在各分组中的极大值作为微生物检测背景菌阈值。本申请的方法可以最大程度地还原真实检测中的背景微生物并消除数据差异。

主权项：1.一种微生物检测背景菌阈值设定方法，所述方法包括以下步骤：S1.检测分组；S2.阴性测试：利用样本按照S1的检测分组分别进行测试；S3.阳性测试：在样本中添加已知微生物，按照S1的检测分组再次分别进行测试；S4.极值计算：在S2和S3的测试结果中除去S2中添加的微生物的测试数据，其他微生物测试数据均一化之后计算在微生物在各分组中的极大值作为微生物检测背景菌阈值；其中所述S4步骤中从S3得到的阳性样本微生物组成谱去除其中已知微生物物种与S2得到的阴性样本微生物组成谱，获得质控背景微生物谱，利用统计学方法计算微生物极大值，步骤包括：（a）对每次实际测序数据量X，将检出背景微生物Reads数Ri按照微生物逐一均一化为数据量C下的Reads数Ni： ；（b）将均一化后的每次检测微生物谱，按照样本类型以及对应的测试试剂和测试方法的分组进行合并；（c）对合并后的微生物谱按照物种分别计算质控背景微生物谱中微生物的25%分位数Q1和75%分位数Q3；（d）极大值M=Q3+1.5×Q3-Q1；以及S5.采用E值判定微生物是背景菌还是检出菌，其中E值为判定该微生物是背景菌还是检出菌的判定值，其计算方法为：Ei=NiNi+Mi；E值越大检出的微生物越趋近于检出菌，越小越趋近于背景菌。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 瑞因迈拓科技(广州)有限公司 一种微生物检测背景菌阈值设定方法及其应用

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