申请/专利权人：山东第一医科大学(山东省医学科学院)

申请日：2021-12-27

公开（公告）日：2024-03-22

公开（公告）号：CN114334010B

主分类号：G16B40/00

分类号：G16B40/00;G16B50/30;G16B50/10;G16B30/00

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.03.22#授权;2022.04.29#实质审查的生效;2022.04.12#公开

摘要：本发明涉及一种用于布尼亚相关病毒属种分类的自动识别方法及系统，该方法包括：从Taxonomy数据库链接到的GenBank数据库中获取布尼亚相关病毒的所有蛋白基因组序列的FASTA格式文件；基于NCBI登录号利用CDD工具对FASTA格式文件进行批量注释并生成布尼亚病毒目RdRp核心保守域序列数据包；安装BLAST工具和CDD工具并搭建自动识别网页；获取用户在自动识别网页提交的待识别病毒序列；利用CDD工具对待识别病毒序列进行筛查，从待识别病毒序列中提取出布尼亚病毒目RdRp核心保守域序列；利用BLAST工具从BLAST本地库中获取多条相似序列的分类信息，该方法可快速获取病毒分类信息。

主权项：1.一种用于布尼亚相关病毒属种分类的自动识别方法，其特征在于，包括：从Taxonomy数据库链接到的GenBank数据库中获取布尼亚相关病毒的所有蛋白基因组序列的FASTA格式文件；基于NCBI登录号利用CDD工具对所述FASTA格式文件进行批量注释并生成布尼亚病毒目RdRp核心保守域序列数据包；安装BLAST工具和所述CDD工具并搭建自动识别网页，将所述布尼亚病毒目RdRp核心保守域序列数据包作为所述自动识别网页的BLAST本地库；获取用户在所述自动识别网页提交的待识别病毒序列；利用所述CDD工具对所述待识别病毒序列进行筛查，如果筛查结果为布尼亚病毒，则从所述待识别病毒序列中提取出待识别的布尼亚病毒目RdRp核心保守域序列；根据所述待识别的布尼亚病毒目RdRp核心保守域序列利用所述BLAST工具从所述BLAST本地库中获取多条相似序列的分类信息。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 山东第一医科大学(山东省医学科学院) 用于布尼亚相关病毒属种分类的自动识别方法及系统

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