申请/专利权人：中国医学科学院药用植物研究所

申请日：2023-01-10

公开（公告）日：2024-03-29

公开（公告）号：CN117778586A

主分类号：C12Q1/6888

分类号：C12Q1/6888;C12N15/11;C12Q1/686;C12Q1/6844

优先权：

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2024.04.16#实质审查的生效;2024.03.29#公开

摘要：本申请公开了基于时珍法的用于鹿科动物鉴定的物种特异性靶标序列、引物对、试剂盒、它们的应用及物种鉴定方法，其中，基于通过时珍法筛选得到的鹿科动物的物种特异性靶标序列，实现了对待检测样品的物种鉴定。本发明的物种鉴定方法特异性强，灵敏度高，重复性好，可实现物种的快速鉴定，具有广阔的应用前景。

主权项：1.一种基于时珍法的鹿科动物鉴定方法，包括：1获取包括待鉴定物种在内的全部鹿科动物各自的全基因组序列，构建包括所述待鉴定物种在内的全部鹿科动物各自的片段序列库；2按如下条件中的至少一种，对所述片段序列库中的序列进行筛选，获得全部鹿科动物各自的候选片段序列库：i候选序列GC含量为40％-60％；ii候选序列不能含有连续4连以上的重复碱基、连续的3连重复碱基、3个以上的3连重复碱基；iii候选序列不能与crRNA重复序列互补；iv候选序列5'端6个碱基GC含量为30％-80％；以及v候选序列所在区域-50bp到+300bp或-300bp到+50bp内不存在连续4个以上的A或GT重复；3将所述待鉴定物种的候选片段序列库与所述待鉴定物种的所有已知的基因组序列进行比对，从所述待鉴定物种的候选片段序列库中筛选出与所述待鉴定物种的所有已知的基因组序列完全匹配的序列，构建所述待鉴定物种的候选靶标序列库；4将所述待鉴定物种的候选靶标序列库中的每一条序列在除所述待鉴定物种之外的全部鹿科动物各自的候选片段序列库中进行比对，筛选出与除所述待鉴定物种之外的其他鹿科动物存在3个以上碱基错配的一条或多条序列作为特异性靶标序列；5基于所述特异性靶标序列设计引物对，提取待检测样品的基因组DNA并使用所述引物对进行扩增，对扩增产物进行检测，检测到相应的扩增产物时，则所述待检测样品与待鉴定物种具有同一性。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 中国医学科学院药用植物研究所 基于时珍法鉴定鹿科动物的物种特异性靶标序列、试剂盒及应用

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