申请/专利权人：河南省畜牧总站

申请日：2021-08-10

公开（公告）日：2024-04-02

公开（公告）号：CN113604583B

主分类号：C12Q1/6888

分类号：C12Q1/6888;C12Q1/686;C12N15/11

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.04.02#授权;2021.11.23#实质审查的生效;2021.11.05#公开

摘要：本发明公开了一种山羊KCNJ15基因CNV标记辅助检测生长性状的方法及其专用试剂盒。以河南波槐山羊、槐山羊、贵州黑山羊、贵州白山羊和太行山羊基因组DNA为模板，利用qPCR技术分别对山羊个体KCNJ15基因的CNV区域和内参基因MC1R的部分片段进行扩增，最后利用2*2‑ΔΔCt判定个体的拷贝数变异类型，并将结果分为多拷贝型、缺失型和正常型。本发明可在DNA水平上检测与山羊生长性状密切相关的CNV标记，加快了山羊优良性能的选育进程，该方法简单、快速，便于推广应用。

主权项：1.一种检测山羊KCNJ15基因拷贝数变异的方法在山羊分子标记辅助选择育种中的应用，其特征在于：所述检测山羊KCNJ15基因拷贝数变异的方法包括以下步骤：以山羊基因组DNA为模板，以引物对P1以及引物对P2为引物，分别通过实时荧光定量PCR扩增位于KCNJ15基因参考基因组序列NC_030808.1的150479082位到150489041位的拷贝数变异区域以及作为内参的MC1R基因的部分片段，然后根据定量结果鉴定KCNJ15基因的拷贝数变异类型；所述引物对P1为：上游引物F1：5’-CCGCTTTCTTGTGAACTTCCAT-3’下游引物R1：5’-CTGTCACGTGTCCAGAAAGTAGA-3’所述引物对P2为：上游引物F2：5’-GGGCAGTCCCTTGACAAAGA-3’下游引物R2：5’-ATCTCCCCAGCCTCCTCATT-3’；所述拷贝数变异类型是根据2*2-ΔΔCt将定量结果分为的三类：多拷贝型，2*2-ΔΔCt2；缺失型，2*2-ΔΔCt2；正常型，2*2-ΔΔCt＝2；在贵州黑山羊中，拷贝数变异位点与个体的管围具有显著的相关性，且正常型的个体优于多拷贝型的个体；在贵州白山羊中，拷贝数变异位点与个体的体重和胸围具有显著的相关性，且拷贝数为3的个体优于拷贝数为4、5的个体；在槐山羊中，拷贝数变异位点与个体的体斜长具有显著的相关性，且多拷贝型的个体优于正常型的个体；在太行山羊中，拷贝数变异位点与个体的体高和体重具有显著的相关性，且正常型的个体优于多拷贝型的个体。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 河南省畜牧总站 一种山羊KCNJ15基因CNV标记辅助检测生长性状的方法及其专用试剂盒

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