申请/专利权人：北京博富瑞基因诊断技术有限公司

申请日：2024-01-10

公开（公告）日：2024-04-02

公开（公告）号：CN117542529B

主分类号：G16H50/30

分类号：G16H50/30;G16H50/70;G16B20/30;G16B40/00;G16B30/00

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.04.02#授权;2024.03.01#实质审查的生效;2024.02.09#公开

摘要：本公开提供一种HLA不相合异基因造血干细胞移植非复发死亡风险的预测方法、系统、设备、存储介质。预测方法包括以下步骤：S100、初步预测：基于生物标志物预测模型初步预测目标对象发生非复发死亡的风险；若目标对象处于非复发死亡中高风险则进入步骤S200；S200、精准预测：基于供者HLA‑II类基因计算HLA‑II类基因第三外显子处的值；比较值与预设的HED阈值，精准预测出目标对象发生非复发死亡的风险。本公开通过引入供者值作为新的风险因素，对初步预测为中高风险的目标对象进行精准预测，以提高预测的精准度以及降低初步预测为中高风险人群的假阳性率。

主权项：1.一种HLA不相合异基因造血干细胞移植非复发死亡风险的预测方法，其特征在于，所述预测方法包括以下步骤：S100、初步预测：基于生物标志物预测模型初步预测目标对象在接受不相合异基因造血干细胞移植后的某一时间点发生非复发死亡的风险程度；若目标对象在当前时间节点处于非复发死亡低风险的情况下，则不进入步骤S200；若目标对象在当前时间节点处于非复发死亡中高风险的情况下，则进入步骤S200；所述初步预测的方法包括以下步骤：S101、获取目标对象在接受不相合异基因造血干细胞移植后的某一时间点的sST2浓度和TNFR1浓度；S102、基于生物标志物预测模型计算目标对象在当前时间点的非复发死亡概率；所述生物标志物预测模型的计算公式为： 其中，P表示非复发死亡概率；表示sST2浓度；表示TNFR1浓度；a、b、c表示生物标志物预测模型训练得到的参数；S103、将非复发死亡概率P与预设的概率阈值进行比较，以初步预测目标对象在接受不相合异基因造血干细胞移植后的发生非复发死亡的风险；S200、精准预测：S201、获取供者HLA-II类基因中DQB1位点基因的核苷酸序列和DRB1位点基因的核苷酸序列；S202、将DQB1位点基因的核苷酸序列解码为相应蛋白质的氨基酸序列；以及将DRB1位点基因的核苷酸序列解码为相应蛋白质的氨基酸序列；S203、根据DQB1位点基因所解码的氨基酸序列，计算得到DQB1位点基因第三外显子处的值；根据DRB1位点基因所解码的氨基酸序列，计算DRB1位点基因第三外显子处的值；HLA-II类基因第三外显子处的值为值和值之和；所述值和所述值的计算公式为： 其中，α、β、γ表示逆均值权重因子；i和j分别表示等位基因在相同位置处的两个氨基酸；c表示氨基酸组成；p表示氨基酸极性；v表示氨基酸分子体积；S204、将值与预设的HED阈值进行比较，以精准预测出目标对象在接受不相合异基因造血干细胞移植后发生非复发死亡的风险。

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