申请/专利权人:西南大学
申请日:2021-10-12
公开(公告)日:2024-04-02
公开(公告)号:CN113881798B
主分类号:C12Q1/6895
分类号:C12Q1/6895;C12Q1/6869;C12Q1/686;C12N15/11
优先权:
专利状态码:有效-授权
法律状态:2024.04.02#授权;2022.01.21#实质审查的生效;2022.01.04#公开
摘要:本发明属于生物信息技术领域,公开了一种叶绿体基因组高变位点及其检测方法与应用,所述叶绿体基因组高变位点由一对引物序列确定,所述引物的核苷酸序列为SEQIDNO:1和SEQIDNO:2;所述叶绿体基因组高变位点的检测方法包括:合成引物;提取待分析柑桔类材料的基因组总DNA,PCR扩增获得高变位点序列;将扩增产物进行电泳检测,回收目的DNA片段;将目的DNA片段加尾,获得重组T载体;将重组T载体转化大肠杆菌感受态细胞;蓝白斑筛选,挑取白色单菌落恒温培养,菌液测序。本发明通过对该序列进行基因组扩增、克隆、测序和比对分析,可以较好地判断不同柑桔果树的胞质来源,实现对柑桔类果树的类群区分。
主权项:1.一种叶绿体基因组高变位点的扩增检测方法,其特征在于,所述叶绿体基因组高变位点的扩增检测方法包括以下步骤:步骤一,合成用于扩增叶绿体基因组高变位点序列的引物,所述引物的核苷酸序列为SEQIDNO:1和SEQIDNO:2;步骤二,提取待分析柑桔类材料的基因组总DNA,DNA聚合酶链式反应PCR扩增获得高变位点序列;步骤三,将扩增产物加入琼脂糖凝胶孔中进行电泳检测,回收目的DNA片段,片段大小为100bp~500bp;步骤四,将回收的目的DNA片段加尾,采用克隆载体pGEM-T-easy获得重组T载体;将连接好的重组T载体转化大肠杆菌感受态细胞E.coliDH5α;蓝白斑筛选,挑取白色单菌落5~6个,LA液体培养基37℃恒温摇床振荡过夜培养,菌液送测序公司测序。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 西南大学 一种叶绿体基因组高变位点及其检测方法与应用
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