申请/专利权人：重庆大学

申请日：2023-12-08

公开（公告）日：2024-04-09

公开（公告）号：CN117854596A

主分类号：G16B40/00

分类号：G16B40/00;G16B25/10;G06F18/214;G06F18/2431;G06N5/01;G06N20/00

优先权：

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2024.04.26#实质审查的生效;2024.04.09#公开

摘要：本发明属于生物技术领域，公开了一种基于肿瘤免疫亚型分类系统及方法，包括：基因筛选模块，进行多个肿瘤组织和癌旁组织间基因差异性分析，获得免疫相关基因；数据收集模块，获取上述免疫相关基因对应的测序数据和基因表达谱数据的样本数据集；分类特征获取模块，计算每一样本所对应的肿瘤组织中的微生物丰度数据、免疫细胞比例数据和与基因表达数据；模型训练模块，构建训练样本数据集，对预设类型的集成分类器进行训练；亚型分类模块，通过训练好的集成分类器实现对肿瘤组织的免疫亚型分类。本发明通过引入微生物丰度数据，免疫细胞比例数据和与免疫紧密相关的hub基因表达数据这三类分类特征，实现了对肿瘤免疫亚型精准分类的目的。

主权项：1.一种基于肿瘤免疫亚型分类系统，其特征在于，包括：基因筛选模块，基于泛癌中代表免疫细胞亚群的相关基因，进行多个肿瘤组织和癌旁组织间基因差异性分析，获得免疫相关基因；数据收集模块，与基因筛选模块连接，用于获取上述免疫相关基因对应的RNA-seq测序数据和基因表达谱数据的样本数据集；分类特征获取模块，与数据收集模块连接，用于计算所述样本数据集中的每一样本所对应的肿瘤组织中的微生物丰度数据、免疫细胞比例数据和与免疫相关的基因表达数据；模型训练模块，与分类特征获取模块连接，用于以微生物丰度数据、免疫细胞比例数据和与免疫相关的基因表达数据为分类特征，构建训练样本数据集，对预设类型的集成分类器进行训练；亚型分类模块，与模型训练模块连接，通过训练好的集成分类器实现对肿瘤组织的免疫亚型分类。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 重庆大学 一种基于肿瘤免疫亚型分类系统及方法

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